300369 UE Genomic approaches to variation, adaptation and speciation (2018S)
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
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An/Abmeldung
Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").
- Anmeldung von Fr 09.02.2018 08:00 bis Do 22.02.2018 18:00
- Abmeldung bis Sa 31.03.2018 18:00
Details
max. 12 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch
Lehrende
Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert
Montag
05.03.
14:00 - 15:00
Hörsaal (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg EG
Montag
14.05.
09:00 - 17:00
Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Dienstag
15.05.
09:00 - 17:00
Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Mittwoch
16.05.
09:00 - 17:00
Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Donnerstag
17.05.
09:00 - 17:00
Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Freitag
18.05.
09:00 - 17:00
Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Information
Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung
Population genomics and genome evolution from next-generation sequencing data, such as whole-genome sequencing, RAD sequencing and transcriptomics. We will exemplify genomic investigation procedures to trace natural selection, genetic ancestry, function, structure and gene-environment interactions, starting with introducing basic omic approaches, such as de novo assembly and mapping. Attendance of the complementary lecture VO300127 is highly recommended.
Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel
Active participation in the practical 4 points, two short written exams 5 points each; mini presentation 6 points; thus totalling 20 points.
Credit key: <10 points: 5; 11-12 points: 4; 13-14 points: 3; 15-17 points 2; 18-20 points: 1.
Credit key: <10 points: 5; 11-12 points: 4; 13-14 points: 3; 15-17 points 2; 18-20 points: 1.
Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab
Attendance of the complementary lecture VO300127 is required - the lectures introduce the necessary theoretical background to the practical aspects done with the students here.
The students are able to understand and apply basic pipelines in genomics (e.g., quality check and filtering of NGS reads; mapping; vcf manipulation; differential expression; SNP calling), and they have good knowledge and skills in the fields of evolutionary and ecological research.
The students are able to understand and apply basic pipelines in genomics (e.g., quality check and filtering of NGS reads; mapping; vcf manipulation; differential expression; SNP calling), and they have good knowledge and skills in the fields of evolutionary and ecological research.
Prüfungsstoff
Practical work at the computer; demonstration
Understanding main concepts in evolutionary and ecological genomics
Integration of methods and data in a scientific presentation
Understanding main concepts in evolutionary and ecological genomics
Integration of methods and data in a scientific presentation
Literatur
Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis
MBO 5, MEV W-1, MEV W-5, MEV W-6, PhD, MES5, MEC-9
Letzte Änderung: Mo 07.09.2020 15:43