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Jetzt impfen lassen für ein sicheres Miteinander im Herbst!

Um allen Angehörigen der Universität Wien einen guten und sicheren Semesterbeginn zu ermöglichen, gibt es von Samstag, 18. September, bis Montag, 20. September die Möglichkeit einer COVID-19-Impfung ohne Terminvereinbarung am Campus der Universität Wien. Details unter https://www.univie.ac.at/ueber-uns/weitere-informationen/coronavirus/.

Achtung! Das Lehrangebot ist noch nicht vollständig und wird bis Semesterbeginn laufend ergänzt.

300627 SE Plant Genome Evolution: Repetitive DNA (2020S)

2.00 ECTS (1.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Details

max. 10 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

VB: 05.03.2020 at 12:15 in ÜR2
19.03.2020: lecture (by course leader)
Other four meetings will be dedicated to students presentations of selected papers

Donnerstag 05.03. 12:15 - 14:00 Übungsraum 2 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Donnerstag 19.03. 12:15 - 14:00 Übungsraum 2 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Donnerstag 26.03. 12:15 - 14:00 Übungsraum 2 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Donnerstag 02.04. 12:15 - 14:00 Übungsraum 2 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Donnerstag 23.04. 12:15 - 14:00 Übungsraum 2 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Donnerstag 30.04. 12:15 - 14:00 Übungsraum 2 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

This course offers the students the possibility to get acquainted with modern literature and recent views on repetitive DNA (tandemly repeated and dispersed including mobile genetic elements) which constitute large fractions of plant genomes. The selected papers will focus on types of repetitive DNA abundance, variation, hypotheses on their origin, factors stimulating their activity in the genome, mechanisms which enable their successful amplification, existence, and evolution in the genome. Furthermore, their impact on genome restructuring on all levels of organization and evolution will be discussed as well as their role in the genome (selfish junk DNA vs. useful collaborator). Students will be able to understand and appreciate different aspects of evolution and role of repetitive DNA in shaping plant genomes, especially in the forthcoming era of genomics. Special emphasis will be on application of next generation sequencing to analyze repetitive DNA pf complex plant genomes, both diploid and polyploid.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Individual presentation of published papers 70% (10.5 pts)
Active participation in discussions 10% (1.5 pts)
Written report (summary of papers and discussion) 20% (3 pts)
The deadline for written report is 30.05.2020

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Minimum requirements for positive credit: 8 points (15 points total)
Credit Key:
0-7.5 pts: 5
8-9.5 pts: 4
10-11,5 pts: 3
12-13,5: 2
14-15 pts: 1

Prüfungsstoff

seminar; reading and understanding of scientific papers; papers' presentation, discussion and critical evaluation of all scientific papers presented

Literatur

In addition to papers chosen for the presentation students can also read general/review material:
1. Volff J.-N. (ed.) 2005. Retrotransposable elements and genome evolution. Karger, Basel.
2. Ayala F.J., Fitch W.M., and Clegg M.T. (eds) 2000. Variation and evolution in plants and microorganisms: toward a new synthesis 50 years after Stebbins. National Academy of Sciences of the USA.
3. Puertas M.J. & Naranjo T. (eds.) 2005. Plant cytogenetics. Karger, Basel.
4. Birchler J. & Pires C. (eds.) 2010. Advanced in Plant Cytogenetics. Karger, Basel.
5. "Plant Genome Diversity" vol. 1 and 2, Springer 2013
selected papers to present

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

MGE III-2, MBO 7

Letzte Änderung: Mo 07.09.2020 15:22