Universität Wien

301080 VU Bioinformatik für Biologen (2022S)

5.00 ECTS (3.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
Moodle

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Details

max. 80 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

HINWEIS: Der erste Termin am 3.3. mit der Vorbesprechung und dem anschließenden ersten Vorlesungsteil wird ONLINE/DIGITAL stattfinden. Der Link zur online Session wird via Moodle zur Verfügung gestellt!

  • Donnerstag 03.03. 10:00 - 13:00 Digital
  • Donnerstag 10.03. 10:00 - 13:00 STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
  • Donnerstag 17.03. 10:00 - 13:00 STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
  • Donnerstag 24.03. 10:00 - 13:00 STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
  • Donnerstag 31.03. 10:00 - 13:00 STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
  • Donnerstag 07.04. 10:00 - 13:00 STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
  • Donnerstag 28.04. 10:00 - 13:00 STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
  • Donnerstag 05.05. 10:00 - 13:00 STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
  • Donnerstag 12.05. 10:00 - 13:00 STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
  • Donnerstag 19.05. 10:00 - 13:00 STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
  • Donnerstag 02.06. 10:00 - 13:00 STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
  • Donnerstag 09.06. 10:00 - 13:00 STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
  • Donnerstag 23.06. 10:00 - 13:00 STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
  • Donnerstag 30.06. 10:00 - 13:00 STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

a. Ziele: Verständnis der grundlegenden Konzepte und Methoden der Bioinformatik;
b. Inhalte: Die Lehrveranstaltung gibt einen breiten Überblick über Methoden und Anwendungen aus den Bioinformatik Bereichen exaktes String-Matching, paarweises Sequenzalignment, multiples Sequenzalignment, Sequenzdatenbanksuche, Wahrscheinlichkeiten auf Sequenzen, hidden Markov Modelle (HMMs), Rekonstruktion phylogenetischer Bäume, Hochdurchsatz-Sequenzierverfahren, Genomassemblierung, Read-Mapping und Genomanalyse;
c. Methoden: Vorlesung, 4 bewertete Hausübungen (Moodle), Hausübungs-Besprechungen, ergänzende Hausübungen (zur Testvorbereitung, nicht bewertet), 2 schriftliche Tests
HINWEIS: Die Vorbesprechung (Platzvergabe) am ersten Termin, Vorlesung, Hausübungs-Besprechungen und Tests werden je nach der aktuellen Situation und den geltenden Corona/COVID-19-Bestimmungen hybrid, in Präsenz oder rein in distance learning online abgehalten werden.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

a. Art der Leistungskontrolle: Im Laufe der VU sind folgende Leistungsüberprüfungen zu absolvieren: 2 schriftliche Tests (Multiple Choice und offene Fragen), die jeweils 30% zählen und jeweils etwa die Hälfte der Lehrstoffs abdecken. So wie 4 Hausübungen, deren Lösungen einzureichen sind und jeweils 10% zählen.
b. Erlaubte Hilfsmittel: Während der Tests sind keine Hilfsmittel erlaubt (auch keine Handys, Smartphones, Taschenrechner, etc).

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

a. Mindestanforderung: Anwesenheit in der Vorbesprechung am ersten Tag (mglw. online). Anwesenheit während des Kurses (diese wird im Rahmen der Tests und Übungsbesprechungen überprüft). Zum Bestehen müssen mindestens 50% der möglichen gewichteten Gesamtpunktzahl erreicht werden. Der tatsächlich erreichte Prozentsatz bestimmt die Note.
b. Beurteilungsmaßstab: Die folgenden erreichten Prozentzahlen entsprechen den folgenden Noten:
>=87.5%: Note 1 (sehr gut)
<87.5%: Note 2 (gut)
<75.0%: Note 3 (befriedigend)
<62.5%: Note 4 (genügend)
<50.0%: Note 5 (nicht genügend)

Prüfungsstoff

Prüfungsrelevant sind alle in der Lehrveranstaltung, den Vorlesungen, den Handouts, den Hausübungen (bewertet und ergänzend) und den Übungsbesprechungen vorkommenden Inhalte.

Literatur

Ein Liste möglicher Literatur wird in der ersten Vorlesungseinheit bekannt gegeben. Zusätzliche Referenzen gibt es im Laufe der Vorlesungen.

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

BMB 7, BMG 7

Letzte Änderung: Do 11.05.2023 11:28