301151 UE UE in Fluoreszenz und Konfokalmikroskopie inkl.Übungen zur Bild-bearbeitung/analyse (2024W)
für Diplomanden, Dissertanden und fortgeschrittene Studenten
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
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Zusammenfassung
An/Abmeldung
Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").
- Anmeldung von Do 12.09.2024 14:00 bis Do 26.09.2024 18:00
- Abmeldung bis Do 26.09.2024 18:00
An/Abmeldeinformationen sind bei der jeweiligen Gruppe verfügbar.
Gruppen
Gruppe 1
max. 12 Teilnehmer*innen
Sprache: Deutsch
Lernplattform: Moodle
Lehrende
Termine
UNTERRICHTSSPRACHE IST ENGLISCH!!!
VORBESPRECHUNG/PRELIMINARY MEETING (DIGITAL VIA ZOOM - siehe unten): 7.10.2024; 10h30die Teilnahme an der Vorbesprechung ist zwingend für eine Kursteilnahme!!Josef Gotzmann is inviting you to a scheduled Zoom meeting.
Topic: Preliminary Meeting ConfCourse WS2024-25
Time: Oct 7, 2024 10:30 AM Vienna
Join Zoom Meeting: https://univienna.zoom.us/j/64153227619?pwd=WvcS0tl0yTbAvayDNnjy1bh2w3UbzE.1
Meeting ID: 641 5322 7619
Passcode: 413363Details zum Kurs in Moodle: https://moodle.univie.ac.at/course/view.php?id=433241!! Die Anmeldung über U:Space für EINEN der beiden angebotenen Kurse (301151-1 oder-2) ist ausreichend!!
!! Die Anmeldung über U:Space bedingt NICHT zwingend auch eine Teilnahmeberechtigung!Im Falle einer Überbuchung greifen die aktuell gültigen SPL Regeln
- Für die ersten 20 Plätze Vorrang für die Studiengänge unseres Master-Programms (865, 830, 834 and 877).
- Vergabe erfolgt nach der Höhe der gesetzten Punkte.
- Eine Quotenregelung von 4 Plätzen (=2/Kurs) für Studiengänge mit naturwissenschaftlichem Background wird angewandt - die Vergabe erfolgt durch den LV-Leiter auch für diese Angemeldeten nach der Höhe der gesetzten Punkte.
- Sollte ein offener Platz im Kurs nicht durch die Punkteregel entschieden werden können (zB gleiche Punkte), dann entscheidet das frühere Anmeldedatum.Beschränkte Teilnehmerzahl: 12 (pro Kurs; insgesamt 24)Details zu Programm und Ablauf in Vorbesprechung.
Die Kurseinteilung erfolgt unmittelbar (2-3 Werktage) nach der Vorbesprechung.
Weitere Details und Informationen werden später über Moodle kommuniziert.Mögliche Änderungen werden zeitnah bekanntgegeben!Termin(e): Abhaltungstermine für BEIDE Kurse : 11.-13.November; 19.+20.November; 26.+27.November; 3.+4.Dezember 2024
Anwesenheit an all diesen Tagen wird zwingend gefordert.
Gruppe 2
max. 12 Teilnehmer*innen
Sprache: Deutsch
Lernplattform: Moodle
Lehrende
Termine
UNTERRICHTSSPRACHE IST ENGLISCH!!!
VORBESPRECHUNG/PRELIMINARY MEETING (DIGITAL VIA ZOOM - siehe unten): 7.10.2024; 10h30die Teilnahme an der Vorbesprechung ist zwingend für eine Kursteilnahme!!Josef Gotzmann is inviting you to a scheduled Zoom meeting.
Topic: Preliminary Meeting ConfCourse WS2024-25
Time: Oct 7, 2024 10:30 AM Vienna
Join Zoom Meeting: https://univienna.zoom.us/j/64153227619?pwd=WvcS0tl0yTbAvayDNnjy1bh2w3UbzE.1
Meeting ID: 641 5322 7619
Passcode: 413363Details zum Kurs in Moodle: https://moodle.univie.ac.at/course/view.php?id=433241!! Die Anmeldung über U:Space für EINEN der beiden angebotenen Kurse (301151-1 oder-2) ist ausreichend!!
!! Die Anmeldung über U:Space bedingt NICHT zwingend auch eine Teilnahmeberechtigung!Im Falle einer Überbuchung greifen die aktuell gültigen SPL Regeln
- Für die ersten 20 Plätze Vorrang für die Studiengänge unseres Master-Programms (865, 830, 834 and 877).
- Vergabe erfolgt nach der Höhe der gesetzten Punkte.
- Eine Quotenregelung von 4 Plätzen (=2/Kurs) für Studiengänge mit naturwissenschaftlichem Background wird angewandt - die Vergabe erfolgt durch den LV-Leiter auch für diese Angemeldeten nach der Höhe der gesetzten Punkte.
- Sollte ein offener Platz im Kurs nicht durch die Punkteregel entschieden werden können (zB gleiche Punkte), dann entscheidet das frühere Anmeldedatum.Beschränkte Teilnehmerzahl: 12 (pro Kurs; insgesamt 24)Details zu Programm und Ablauf in Vorbesprechung.
Die Kurseinteilung erfolgt unmittelbar (2-3 Werktage) nach der Vorbesprechung.
Weitere Details und Informationen werden später über Moodle kommuniziert.Mögliche Änderungen werden zeitnah bekanntgegeben!Termin(e): Abhaltungstermine für BEIDE Kurse : 11.-13.November; 19.+20.November; 26.+27.November; 3.+4.Dezember 2024
Anwesenheit an all diesen Tagen wird zwingend gefordert.
Information
Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung
Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel
Verpflichtende Anwesenheit. Die Beurteilung basiert auf folgenden Teilleistungen: Aktive Teilnahme und Ergebnis der Versuche, laufend Kontrolle des theoretischen Wissens (50%/20%/30%). Jede der Teilleistungen muss positiv sein.
Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab
Ziel des Kurses ist es theoretische und praktische Unterstützung für Studierende zu vermitteln, die bereits oder in naher Zukunft lichtmikroskopische Experimente durchführen (zB im Rahmen von Master/PhD/PostDoc-Arbeiten). Die gewählte Gruppengröße (2 Personen) ermöglicht ein äußert effizientes Arbeiten in einem "Privatissimum"-ähnlichen Setting.
Prüfungsstoff
Probenpräparation Lichtmikroskopie
Standard Fluoreszenzmikroskopie-theoretische Grundlagen
Messen von point spread function
Ermitteln der chromatischen Aberration
Theorie und Praxis: Konfokalmikroskopie
Bildbearbeitung
Standard Fluoreszenzmikroskopie-theoretische Grundlagen
Messen von point spread function
Ermitteln der chromatischen Aberration
Theorie und Praxis: Konfokalmikroskopie
Bildbearbeitung
Literatur
J.Pawley, Handbook of Biological Confocal Microscopy, Springer, 2006
D.B.Murphy, Fundamentals of Light Microscopy and Electronic Imaging, Wiley, 2001 / 2009
E.M.Goldys, Flurescence Applications in Biotechnology and the Life Sciences, Wiley, 2009
Kevin F. Sullivan, Fluorescent Proteins (Methods in Cell Biology) , Academic Press, 2008
Molecular Biology of the Cell, Alberts, Garland Sciences,
Review series on „Imaging in Cell Biology“ in Nature Cell Biology Vol 5 (2003) Supplement
Review series on „Biological Imaging“ in Science Vol 300 (2003), 82-99
Eric C. Wait, Michael A. Reiche, Teng-Leong Chew: “Hypothesis-driven quantitative fluorescence microscopy – the importance of reverse-thinking in experimental design”, Journal of Cell Science 2020 133: jcs250027 doi: 10.1242/jcs.250027
Jonkman, J., Brown, C.M., Wright, G.D. et al. Guidance for quantitative confocal microscopy. Nat Protoc (2020). https://doi.org/10.1038/s41596-020-0307-7
https://www.ibiology.org/online-biology-courses/microscopy-series/
D.B.Murphy, Fundamentals of Light Microscopy and Electronic Imaging, Wiley, 2001 / 2009
E.M.Goldys, Flurescence Applications in Biotechnology and the Life Sciences, Wiley, 2009
Kevin F. Sullivan, Fluorescent Proteins (Methods in Cell Biology) , Academic Press, 2008
Molecular Biology of the Cell, Alberts, Garland Sciences,
Review series on „Imaging in Cell Biology“ in Nature Cell Biology Vol 5 (2003) Supplement
Review series on „Biological Imaging“ in Science Vol 300 (2003), 82-99
Eric C. Wait, Michael A. Reiche, Teng-Leong Chew: “Hypothesis-driven quantitative fluorescence microscopy – the importance of reverse-thinking in experimental design”, Journal of Cell Science 2020 133: jcs250027 doi: 10.1242/jcs.250027
Jonkman, J., Brown, C.M., Wright, G.D. et al. Guidance for quantitative confocal microscopy. Nat Protoc (2020). https://doi.org/10.1038/s41596-020-0307-7
https://www.ibiology.org/online-biology-courses/microscopy-series/
Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis
MMB III-1a:, MMB III-2a:, MMB III-3a:, MMB III-4a:, PhD, MMEI III
Letzte Änderung: Mo 16.09.2024 08:26
Qualitätskriterien und AberrationskorrekturenSELBSTÄNDIGES Mikroskopieren von ausgewählten Proben mittels Konfokalmikroskopie (Mehrkanalaufnahmen, serielle optische Schnitte durch Proben, Bildprojektionen, Aufnehmen von Zeitserien)2 volle Arbeitstage: Bildanalyse und Dekonvolution von eigens angefertigten Bildern, Einführung in Image J