Universität Wien FIND

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301185 VO Structural Bioinformatics I (2018W)

3.00 ECTS (2.00 SWS), SPL 30 - Biologie

An/Abmeldung

Details

Sprache: Englisch

Prüfungstermine

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

Preliminary meeting: 11am,October the 5, 2018 in the Seminar Room of the Dept. Structural and Computational Biology.

Lectures in the EDV Room of the Dept. Structural and Computational Biology:

Monday, January 14, 2019: 10-12 and 13-17
Tuesday, January 15, 2019: 10-12 and 13-17
Wednesday, January 16, 2019: 10-12 and 13-17
Thursday, January 17, 2019: 10-12 and 13-17
Friday, January 18, 2019: 10-12 and 13-17

Exams in my office at the Dept. Structural and Computational Biology (always at 9.30):

Friday, February 15, 2019
Friday, March 8, 2019
Friday, April 12, 2019
Friday, May 24, 2019

Montag 14.01. 13:00 - 17:00 STB/EDV-Raum Campus Vienna Biocenter, 1030 Wien
Dienstag 15.01. 13:00 - 17:00 STB/EDV-Raum Campus Vienna Biocenter, 1030 Wien
Mittwoch 16.01. 13:00 - 17:00 STB/EDV-Raum Campus Vienna Biocenter, 1030 Wien
Donnerstag 17.01. 13:00 - 17:00 STB/EDV-Raum Campus Vienna Biocenter, 1030 Wien
Freitag 18.01. 13:00 - 17:00 STB/EDV-Raum Campus Vienna Biocenter, 1030 Wien

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Programme Introduction to the molecular graphics and analysis of the most common protein folds with RasMol, Pymol and Chimera. Measurements of structural similarity between proteins, theory and applications (Dalilite, CE, PDBeFold and other tools). Databases of macromolecular structures: the Protein Data Bank, the wwPDB and the ePDB. Databases of structural domains: CATH, SCOP, and SCOP2. Databases of protein domains: Pfam, InterPro, InterProScan. Databases of computational models: ModBase and BioModels. Validation of experimental macromolecular structures. The problem of data redundancy.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Schriftliche Abschlussprüfung

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Prüfungsstoff

Literatur


Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

MMB II-2, MMB W-2, MGE III-2, MMEI III, M-WZB, PhD MB 1,UF MA BU 01, UF MA BU 04

Letzte Änderung: Mo 07.09.2020 15:44