Universität Wien
Achtung! Das Lehrangebot ist noch nicht vollständig und wird bis Semesterbeginn laufend ergänzt.

301185 VO Structural Bioinformatics I (2018W)

3.00 ECTS (2.00 SWS), SPL 30 - Biologie
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Sprache: Englisch

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Lehrende

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Preliminary meeting: 11am,October the 5, 2018 in the Seminar Room of the Dept. Structural and Computational Biology.

Lectures in the EDV Room of the Dept. Structural and Computational Biology:

Monday, January 14, 2019: 10-12 and 13-17
Tuesday, January 15, 2019: 10-12 and 13-17
Wednesday, January 16, 2019: 10-12 and 13-17
Thursday, January 17, 2019: 10-12 and 13-17
Friday, January 18, 2019: 10-12 and 13-17

Exams in my office at the Dept. Structural and Computational Biology (always at 9.30):

Friday, February 15, 2019
Friday, March 8, 2019
Friday, April 12, 2019
Friday, May 24, 2019

  • Montag 14.01. 13:00 - 17:00 CCR03-Raum 1.113 Campus Vienna Biocenter, 1030 Wien
  • Dienstag 15.01. 13:00 - 17:00 CCR03-Raum 1.113 Campus Vienna Biocenter, 1030 Wien
  • Mittwoch 16.01. 13:00 - 17:00 CCR03-Raum 1.113 Campus Vienna Biocenter, 1030 Wien
  • Donnerstag 17.01. 13:00 - 17:00 CCR03-Raum 1.113 Campus Vienna Biocenter, 1030 Wien
  • Freitag 18.01. 13:00 - 17:00 CCR03-Raum 1.113 Campus Vienna Biocenter, 1030 Wien

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Programme Introduction to the molecular graphics and analysis of the most common protein folds with RasMol, Pymol and Chimera. Measurements of structural similarity between proteins, theory and applications (Dalilite, CE, PDBeFold and other tools). Databases of macromolecular structures: the Protein Data Bank, the wwPDB and the ePDB. Databases of structural domains: CATH, SCOP, and SCOP2. Databases of protein domains: Pfam, InterPro, InterProScan. Databases of computational models: ModBase and BioModels. Validation of experimental macromolecular structures. The problem of data redundancy.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Schriftliche Abschlussprüfung

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Prüfungsstoff

Literatur

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

MMB II-2, MMB W-2, MGE III-2, MMEI III, M-WZB, PhD MB 1,UF MA BU 01, UF MA BU 04

Letzte Änderung: Mi 13.12.2023 00:22