Universität Wien

301185 VO Structural Bioinformatics I (2019W)

3.00 ECTS (2.00 SWS), SPL 30 - Biologie
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Details

Sprache: Englisch

Prüfungstermine

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

Preliminary meeting with the students: Seminar Room VBC 5
Friday, October 11, 11-12

Lectures: Computer Room VBC 5
Mo 13 January 10-12, 13-16
Tu 14 January 10-12, 13-16
We 15 January 10-12, 13-16
Th 16 January 10-12, 13-16
Fr 17 January 10-12, 13-16

Exams:
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  • Freitag 11.10. 11:00 - 12:00 STB/Seminarraum Strukturchemie Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien (Vorbesprechung)
  • Montag 13.01. 10:00 - 12:00 CCR03-Raum 1.113 Campus Vienna Biocenter, 1030 Wien
  • Montag 13.01. 13:00 - 16:00 CCR03-Raum 1.113 Campus Vienna Biocenter, 1030 Wien
  • Dienstag 14.01. 10:00 - 12:00 CCR03-Raum 1.113 Campus Vienna Biocenter, 1030 Wien
  • Dienstag 14.01. 13:00 - 16:00 CCR03-Raum 1.113 Campus Vienna Biocenter, 1030 Wien
  • Mittwoch 15.01. 10:00 - 12:00 CCR03-Raum 1.113 Campus Vienna Biocenter, 1030 Wien
  • Mittwoch 15.01. 13:00 - 16:00 CCR03-Raum 1.113 Campus Vienna Biocenter, 1030 Wien
  • Donnerstag 16.01. 10:00 - 12:00 CCR03-Raum 1.113 Campus Vienna Biocenter, 1030 Wien
  • Donnerstag 16.01. 13:00 - 16:00 CCR03-Raum 1.113 Campus Vienna Biocenter, 1030 Wien
  • Freitag 17.01. 10:00 - 12:00 CCR03-Raum 1.113 Campus Vienna Biocenter, 1030 Wien
  • Freitag 17.01. 13:00 - 16:00 CCR03-Raum 1.113 Campus Vienna Biocenter, 1030 Wien

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Programme Introduction to the molecular graphics and analysis of the most common protein folds with RasMol, Pymol and Chimera. Measurements of structural similarity between proteins, theory and applications (Dalilite, CE, PDBeFold and other tools). Databases of macromolecular structures: the Protein Data Bank, the wwPDB and the ePDB. Databases of structural domains: CATH, SCOP, and SCOP2. Databases of protein domains: Pfam, InterPro, InterProScan. Databases of computational models: ModBase and BioModels. Validation of experimental macromolecular structures. The problem of data redundancy.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Schriftliche Abschlussprüfung

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Prüfungsstoff

Literatur

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

MMB II-2, MMB W-2, MGE III-2, MMEI III, M-WZB, PhD MB 1,UF MA BU 01, UF MA BU 04

Letzte Änderung: Do 20.02.2025 00:20