Universität Wien FIND

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Achtung! Das Lehrangebot ist noch nicht vollständig und wird bis Semesterbeginn laufend ergänzt.

301185 VO Structural Bioinformatics I (2020W)

3.00 ECTS (2.00 SWS), SPL 30 - Biologie

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Details

Sprache: Englisch

Prüfungstermine

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

-digitale Lehre-
A preliminary meeting will take place in the Seminar room of the Dept. Structural and Computational Biology at 15 AM on October 9, 2020.

the lectures will be in the PC room of the Dept. Structural and Computational Biology from 10 AM to 16 AM on the following days:

January 11 2021
January 12 2021
January 13 2021
January 14 2021
January 15 2021

Exams:
Take an appointment

Montag 11.01. 10:00 - 16:00 Digital
Dienstag 12.01. 10:00 - 16:00 Digital
Mittwoch 13.01. 10:00 - 16:00 Digital
Donnerstag 14.01. 10:00 - 16:00 Digital
Freitag 15.01. 10:00 - 16:00 Digital

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Programme Introduction to the molecular graphics and analysis of the most common protein folds with RasMol, Pymol and Chimera. Measurements of structural similarity between proteins, theory and applications (Dalilite, CE, PDBeFold and other tools). Databases of macromolecular structures: the Protein Data Bank, the wwPDB and the ePDB. Databases of structural domains: CATH, SCOP, and SCOP2. Databases of protein domains: Pfam, InterPro, InterProScan. Databases of computational models: ModBase and BioModels. Validation of experimental macromolecular structures. The problem of data redundancy.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Schriftliche Abschlussprüfung

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Prüfungsstoff

Literatur


Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

MMB II-2, MMB W-2, MGE III-2, MMEI III, M-WZB, PhD MB 1,UF MA BU 01, UF MA BU 04

Letzte Änderung: Mi 30.06.2021 10:29