301185 VO Structural Bioinformatics I (2020W)
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Details
Sprache: Englisch
Prüfungstermine
Lehrende
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-digitale Lehre-
A preliminary meeting will take place in the Seminar room of the Dept. Structural and Computational Biology at 15 AM on October 9, 2020.
January 12 2021
January 13 2021
January 14 2021
January 15 2021Exams:
Take an appointment
- Montag 11.01. 10:00 - 16:00 Digital
- Dienstag 12.01. 10:00 - 16:00 Digital
- Mittwoch 13.01. 10:00 - 16:00 Digital
- Donnerstag 14.01. 10:00 - 16:00 Digital
- Freitag 15.01. 10:00 - 16:00 Digital
Information
Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung
Programme Introduction to the molecular graphics and analysis of the most common protein folds with RasMol, Pymol and Chimera. Measurements of structural similarity between proteins, theory and applications (Dalilite, CE, PDBeFold and other tools). Databases of macromolecular structures: the Protein Data Bank, the wwPDB and the ePDB. Databases of structural domains: CATH, SCOP, and SCOP2. Databases of protein domains: Pfam, InterPro, InterProScan. Databases of computational models: ModBase and BioModels. Validation of experimental macromolecular structures. The problem of data redundancy.
Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel
Schriftliche Abschlussprüfung
Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab
Prüfungsstoff
Literatur
Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis
MMB II-2, MMB W-2, MGE III-2, MMEI III, M-WZB, PhD MB 1,UF MA BU 01, UF MA BU 04
Letzte Änderung: Fr 12.05.2023 00:24