Universität Wien

301214 UE Toolkit für in silico Sequenzanalysen (2020S)

vormals UE IIIB

3.00 ECTS (2.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung

Zusammenfassung

1 Kovarik , Moodle
2 Eislmayr , Moodle
3 Sneezum , Moodle

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").
An/Abmeldeinformationen sind bei der jeweiligen Gruppe verfügbar.

Gruppen

Gruppe 1

max. 18 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch
Lernplattform: Moodle

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

Vorbesprechung: 3.3.2020, 12.00 Uhr - SR 1/6.Stock
Termin: 30.3. - 3.4.2020 - 9.00 - 17.00 Uhr
EDV-Schulungsraum/BZB, Dr.Bohrgasse 9/6.Stock 1030 Wien.

Wer die UE IIIB bereits im Bachelor absolviert hat, kann diese UE im Master nicht nochmals machen!

  • Dienstag 03.03. 12:00 - 13:00 BZB/Seminarraum 1/2, 6.Ebene 6.501/6.504, Dr.-Bohr-Gasse 9, 1030 Wien
    BZB/Seminarraum 1/2, 6.Ebene 6.501/6.504, Dr.-Bohr-Gasse 9, 1030 Wien
    (Vorbesprechung)
  • Montag 30.03. 09:00 - 17:00 BZB/Seminarraum 3, 6.Ebene 6.105, Dr.-Bohrgasse 9, 1030 Wien
  • Dienstag 31.03. 09:00 - 17:00 BZB/Seminarraum 3, 6.Ebene 6.105, Dr.-Bohrgasse 9, 1030 Wien
  • Mittwoch 01.04. 09:00 - 17:00 BZB/Seminarraum 3, 6.Ebene 6.105, Dr.-Bohrgasse 9, 1030 Wien
  • Donnerstag 02.04. 09:00 - 17:00 BZB/Seminarraum 3, 6.Ebene 6.105, Dr.-Bohrgasse 9, 1030 Wien
  • Freitag 03.04. 09:00 - 17:00 BZB/Seminarraum 3, 6.Ebene 6.105, Dr.-Bohrgasse 9, 1030 Wien

Gruppe 2

max. 18 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch
Lernplattform: Moodle

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

Vorbesprechung:3.3.2020, 12.00 Uhr SR 1 /6.Stock
Termin: 20. - 24.4.2020 ganztägig
EDV-Schulungsraum/BZB, Dr.Bohrgasse 9/6.Stock 1030 Wien.

Wer die UE IIIB bereits im Bachelor absolviert hat, kann diese UE im Master nicht nochmals machen!

  • Dienstag 03.03. 12:00 - 13:00 BZB/Seminarraum 1/2, 6.Ebene 6.501/6.504, Dr.-Bohr-Gasse 9, 1030 Wien (Vorbesprechung)
  • Montag 20.04. 09:00 - 17:00 BZB/Seminarraum 3, 6.Ebene 6.105, Dr.-Bohrgasse 9, 1030 Wien
  • Dienstag 21.04. 09:00 - 17:00 BZB/Seminarraum 3, 6.Ebene 6.105, Dr.-Bohrgasse 9, 1030 Wien
  • Mittwoch 22.04. 09:00 - 17:00 BZB/Seminarraum 3, 6.Ebene 6.105, Dr.-Bohrgasse 9, 1030 Wien
  • Donnerstag 23.04. 09:00 - 17:00 BZB/Seminarraum 3, 6.Ebene 6.105, Dr.-Bohrgasse 9, 1030 Wien
  • Freitag 24.04. 09:00 - 17:00 BZB/Seminarraum 3, 6.Ebene 6.105, Dr.-Bohrgasse 9, 1030 Wien

Gruppe 3

max. 18 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch
Lernplattform: Moodle

Lehrende

Termine

Vorbesprechung: 3.3.2020, 12.00 Uhr SR 1 /6.Stock
Termin: 11. - 15.5.2020 ganztägig
EDV-Schulungsraum/BZB, Dr.Bohrgasse 9/6.Stock 1030 Wien.

Wer die UE IIIB bereits im Bachelor absolviert hat, kann diese UE im Master nicht nochmals machen!


Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Ziele: Erwerben von Fähigkeiten, Datenbanken für Genom-, DNA-, RNA- und Protein-Sequenzen zu verwenden und diese Sequenzen für die grundlegenden Aufgaben der molekularbiologischen Forschung zu analysieren.
Inhalte: Suche und Findung von Sequenzen; Sequenzvergleich und Analyse von Homologien; Identifikation von Proteindomänen mittels multiple sequence alignment; in silico Plasmidklonierung; Design von Genomeditierung mittels CRISPR/Cas9; Design von Primern für qPCR, PCR; Analyse von qPCR-Experimenten; Proteinstrukturen
Methoden: Praktische Übung am Computer

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Art der Leistungskontrolle: Die Beurteilung basiert auf folgenden Teilleistungen: Aktive Teilnahme und Lösung von Aufgaben Versuche, schriftliches Protokoll und Abschlussprüfung.
erlaubte Hilfsmittel: eigene Notizen und Mitschrift, Computer, Internet

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Mindestanforderung: Anwesenheit, Abgabe des Protokolls, Abschlussprüfung (jede der Teilleistungen muss positiv sein).
Beurteilungsmaßstab: aktive Mitarbeit 25%, Protokoll 25%, Abschlussprüfung 50%

Prüfungsstoff

Inhalt der Übungseinheiten

Literatur

Beschreibungen und Referenzen der Originalliteratur auf den Web-Seiten der Datenbanken und Web-Services

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

MMB I-2, MMB II-2, MMB III-2, MMB W-2, MGE III-1, MGE III-2, MMEI III, WZB

Letzte Änderung: Do 13.07.2023 00:23