Universität Wien

301214 UE Toolkit für in silico Sequenzanalysen (2020W)

vormals UE IIIB

3.00 ECTS (2.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung

Zusammenfassung

1 DIGITAL Kovarik , Moodle
2 VOR-ORT Dammermann , Moodle
3 DIGITAL Eislmayr , Moodle

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").
An/Abmeldeinformationen sind bei der jeweiligen Gruppe verfügbar.

Gruppen

Gruppe 1

max. 18 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch
Lernplattform: Moodle

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

-digitale-Lehre-
Verpflichtende Vorbesprechung: 5.10.2020, 12.00-13.00 Uhr
Join Zoom Meeting
https://us02web.zoom.us/j/84025409986?pwd=WVZLUWZnTmdOaTVSVndMeGFtVldwUT09

Meeting ID: 840 2540 9986
Passcode: RJ0byM

Termin: 2. - 6.11.2020, 9.00 - 17.00 Uhr

Wenn die Lehrveranstaltung bereits im Bachelorstudium absolviert wurde, kann sie im Masterstudium (A 066830, A 066 834, A 066 877) nicht anerkannt werden.

Siehe auch Studentenseite der Departments:
http://molekularebiologie.univie.ac.at/

Montag 05.10. 12:00 - 13:00 Digital (Vorbesprechung)
Montag 02.11. 09:00 - 17:00 Digital
Dienstag 03.11. 09:00 - 17:00 Digital
Mittwoch 04.11. 09:00 - 17:00 Digital
Donnerstag 05.11. 09:00 - 17:00 Digital
Freitag 06.11. 09:00 - 17:00 Digital

Gruppe 2

max. 9 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch
Lernplattform: Moodle

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

Verpflichtende Vorbesprechung: 5.10.2020, 12.00 - 13.00 Uhr -digital-
Join Zoom Meeting
https://us02web.zoom.us/j/84025409986?pwd=WVZLUWZnTmdOaTVSVndMeGFtVldwUT09

Meeting ID: 840 2540 9986
Passcode: RJ0byM

Termin: 9. - 13.11.2020, 9.00 - 17.00 Uhr
Ort: BZB, EDV-Kursraum, Dr. Bohrgasse, 1030 Wien

Wenn die Lehrveranstaltung bereits im Bachelorstudium absolviert wurde, kann sie im Masterstudium (A 066830, A 066 834, A 066 877) nicht anerkannt werden.

Siehe auch Studentenseite der Departments: http://molekularebiologie.univie.ac.at/

Montag 05.10. 12:00 - 13:00 Digital (Vorbesprechung)
Montag 09.11. 09:00 - 17:00 BZB/Seminarraum 3, 6.Ebene 6.105, Dr.-Bohrgasse 9, 1030 Wien
Dienstag 10.11. 09:00 - 17:00 BZB/Seminarraum 3, 6.Ebene 6.105, Dr.-Bohrgasse 9, 1030 Wien
Mittwoch 11.11. 09:00 - 17:00 BZB/Seminarraum 3, 6.Ebene 6.105, Dr.-Bohrgasse 9, 1030 Wien
Donnerstag 12.11. 09:00 - 17:00 BZB/Seminarraum 3, 6.Ebene 6.105, Dr.-Bohrgasse 9, 1030 Wien
Freitag 13.11. 09:00 - 17:00 BZB/Seminarraum 3, 6.Ebene 6.105, Dr.-Bohrgasse 9, 1030 Wien

Gruppe 3

max. 18 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch
Lernplattform: Moodle

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

-digitale Lehre-
Verpflichtende Vorbesprechung: 5.10.2020, 12:00 - 13:00 Uhr
Join Zoom Meeting
https://us02web.zoom.us/j/84025409986?pwd=WVZLUWZnTmdOaTVSVndMeGFtVldwUT09

Meeting ID: 840 2540 9986
Passcode: RJ0byM

16.-20.11.2010, 9.00 - 17.00 Uhr

Wenn die Lehrveranstaltung bereits im Bachelorstudium absolviert wurde, kann sie im Masterstudium (A 066830, A 066 834, A 066 877) nicht anerkannt werden.

Siehe auch Studentenseite der Departments:
http://molekularebiologie.univie.ac.at/

Montag 05.10. 12:00 - 13:00 Digital (Vorbesprechung)
Montag 16.11. 09:00 - 17:00 Digital
Dienstag 17.11. 09:00 - 17:00 Digital
Mittwoch 18.11. 09:00 - 17:00 Digital
Donnerstag 19.11. 09:00 - 17:00 Digital
Freitag 20.11. 09:00 - 17:00 Digital

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Ziele:
Erwerben von Fähigkeiten, Datenbanken für Genom-, DNA-, RNA- und Protein-Sequenzen zu verwenden und diese Sequenzen für die grundlegenden Aufgaben der molekularbiologischen Forschung zu analysieren.
Inhalte:
Suche und Findung von Sequenzen; Sequenzvergleich und Analyse von Homologien; Identifikation von Proteindomänen mittels „multiple sequence alignment“; in silico Plasmidklonierung; Design von Genomeditierung mittels CRISPR/Cas9; Design von Primern für qPCR, PCR; Analyse von qPCR-Experimenten; Proteinstrukturen
Methoden:
Praktische Übung am Computer

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Aktive Teilnahme und Lösung von Aufgaben Versuche, schriftliches Protokoll und Abschlussprüfung.

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Beurteilt wird: Aktive Mitarbeit, Protokoll, Abschlussprüfung
Gesamtbeurteilung: aktive Mitarbeit 25%, Protokoll 25%, Abschlussprüfung 50%
Jede der Teilleistungen muss positiv sein.

Prüfungsstoff

Inhalt der Übungseinheiten

Literatur

Unterlagen und Programm in Moodle; Originalliteratur auf den Web-Seiten der Datenbanken und Web-Services

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

MMB I-2, MMB II-2, MMB III-2, MMB W-2, MGE III-1, MGE III-2, MMEI III

Letzte Änderung: Do 13.07.2023 00:23