Universität Wien

301214 UE Toolkit für in silico Sequenzanalysen (2023S)

vormals UE IIIB

3.00 ECTS (2.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
Moodle

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Details

max. 18 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

Vorbesprechung: 15.3 2023, 10.00 - 11:30 Uhr
Ort : VBC 5 Hörsaal B/ Room 1.210

  • Montag 24.04. 09:00 - 17:00 BZB EDV-Raum CCR01, 6.Ebene 6.505, Dr.-Bohr-Gasse 9, 1030 Wien
  • Dienstag 25.04. 09:00 - 17:00 BZB EDV-Raum CCR01, 6.Ebene 6.505, Dr.-Bohr-Gasse 9, 1030 Wien
  • Mittwoch 26.04. 09:00 - 17:00 BZB EDV-Raum CCR01, 6.Ebene 6.505, Dr.-Bohr-Gasse 9, 1030 Wien
  • Donnerstag 27.04. 09:00 - 17:00 BZB EDV-Raum CCR01, 6.Ebene 6.505, Dr.-Bohr-Gasse 9, 1030 Wien
  • Freitag 28.04. 09:00 - 17:00 BZB EDV-Raum CCR01, 6.Ebene 6.505, Dr.-Bohr-Gasse 9, 1030 Wien

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Ziele: Erwerben von Fähigkeiten, Datenbanken für Genom-, DNA-, RNA- und Protein-Sequenzen zu verwenden und diese Sequenzen für die grundlegenden Aufgaben der molekularbiologischen Forschung zu analysieren.
Inhalte: Suche und Findung von Sequenzen; Sequenzvergleich und Analyse von Homologien; Identifikation von Proteindomänen mittels multiple sequence alignment; in silico Plasmidklonierung; Design von Genomeditierung mittels CRISPR/Cas9; Design von Primern für qPCR, PCR; Analyse von qPCR-Experimenten; Proteinstrukturen
Methoden: Praktische Übung am Computer

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Art der Leistungskontrolle: Die Beurteilung basiert auf folgenden Teilleistungen: Aktive Teilnahme und Lösung von Aufgaben Versuche, schriftliches Protokoll und Abschlussprüfung.
erlaubte Hilfsmittel: eigene Notizen und Mitschrift, Computer, Internet

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Mindestanforderung: Anwesenheit, Abgabe des Protokolls, Abschlussprüfung (jede der Teilleistungen muss positiv sein).
Beurteilungsmaßstab: aktive Mitarbeit 25%, Protokoll 25%, Abschlussprüfung 50%

Prüfungsstoff

Inhalt der Übungseinheiten

Literatur

Beschreibungen und Referenzen der Originalliteratur auf den Web-Seiten der Datenbanken und Web-Services

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

MMB I-2, MMB II-2, MMB III-2, MMB W-2, MGE III-1, MGE III-2, MMEI III, MMB II.

Letzte Änderung: Mo 04.09.2023 12:48