Universität Wien FIND

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301232 VO Computergestuetzte Strukturelle Biologie (2021S)

3.00 ECTS (2.00 SWS), SPL 30 - Biologie
DIGITAL

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Details

Sprache: Englisch

Prüfungstermine

Lehrende

Termine

-digitale Lehre-
Vorbesprechung: 3.3.21, 11.30 am via Zoom:

https://us02web.zoom.us/j/83875604764?pwd=bFdzdFNtT2s5cDF3UDJRTU84VjFrdz09

Meeting ID: 838 7560 4764
Passcode: 594564

Termine: täglich 9 - 12 Uhr
8. - 19.3.21


Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Computergestuetzte Methoden sind ein unerlaesslicher Teil der modernen Strukturbiologie und Biophysik Forschung. In diesem Kurs werden die Grundlagen der Modellierung von biomolekularen Strukturen und deren Dynamik auf dem Niveau einzelner Moleküle und mit der Hilfe von physikalisch-realistischen Modellen vorgestellt. Die Themen: die Grundlagen von Molekulardynamik und Monte Carlo Simulationen der Biomolekuele, die Entwicklung und die Anwendung von Kraftfeldern, die Behandlung von Loesungsmittel und Elektrostatik, computergestuetzte Techniken in biomolekularer Strukturverfeinerung, Berechnung von freien Energien und Proteinstrukturvorhersage.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Schriftliche Pruefung

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

a. Mindestanforderung: Für das Erreichen einer positiven Note müssen 50 % der maximal möglichen Punkteanzahl erreicht werden. b. Beurteilungsmassstab - 1 : 90-100%; 2 : 75-89.99%; 3 : 60-74.99%; 4 : 50-59.99%; 5 : 0-49.99%.

Prüfungsstoff

Inhalt der Vorlesungseinheiten d.h. Inhalt der Vorlesungssfolien.

Literatur

Dan Frenkel and Berend Smit: Understanding Molecular Simulation, ISBN ISBN: 9780122673511; Andrew Leach: Molecular Modeling, ISBN-13: 978-0582382107

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

MMB I-3, MMB I-4, MMB II-3, MMB II-4, MMEI III, PhD MB 1, PhD MB 2

Letzte Änderung: Do 01.07.2021 15:48