Universität Wien
Achtung! Das Lehrangebot ist noch nicht vollständig und wird bis Semesterbeginn laufend ergänzt.

301232 VO Computergestuetzte Strukturelle Biologie (2025S)

3.00 ECTS (2.00 SWS), SPL 30 - Biologie

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Details

Sprache: Englisch

Lehrende

Termine

Vorbesprechung: 06.03.25, 13.00, HS B, VBC5, Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien

Vorlesungen: 17.3.25 - 28.3.25, 9 - 12 pm

Ort:
17.3.25, HS B, VBC5, Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
18.3.25, HS A, VBC5, Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
19.3.25, HS B, VBC5, Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien (8.30 - 10.30)
20.3.5- 28.3.25 Computer rooms 1&2 (6.505 - 6.506), Max Perutz Labs, Dr. Bohrgasse 9, 1030 Wien


Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Computergestuetzte Methoden sind ein unerlaesslicher Teil der modernen Strukturbiologie und Biophysik Forschung. In diesem Kurs werden die Grundlagen der Modellierung von biomolekularen Strukturen und deren Dynamik auf dem Niveau einzelner Moleküle und mit der Hilfe von physikalisch-realistischen Modellen vorgestellt. Die Themen: die Grundlagen von Molekulardynamik und Monte Carlo Simulationen der Biomolekuele, die Entwicklung und die Anwendung von Kraftfeldern, die Behandlung von Loesungsmittel und Elektrostatik, computergestuetzte Techniken in biomolekularer Strukturverfeinerung, Berechnung von freien Energien und Proteinstrukturvorhersage. Bei Interesse wird den Studierenden empfohlen, auch die praktischen Übungen zu diesem Kurs zu besuchen, UE 301236-1 UE zur computergestützten strukturellen Biologie.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Schriftliche Pruefung

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

a. Mindestanforderung: Für das Erreichen einer positiven Note müssen 50 % der maximal möglichen Punkteanzahl erreicht werden. b. Beurteilungsmassstab - 1 : 90-100%; 2 : 75-89.99%; 3 : 60-74.99%; 4 : 50-59.99%; 5 : 0-49.99%.

Prüfungsstoff

Inhalt der Vorlesungseinheiten d.h. Inhalt der Vorlesungssfolien.

Literatur

Dan Frenkel and Berend Smit: Understanding Molecular Simulation, ISBN ISBN: 9780122673511; Andrew Leach: Molecular Modeling, ISBN-13: 978-0582382107

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

MMB III-1a:, MMEI III, PhD

Letzte Änderung: Fr 17.01.2025 12:46