Universität Wien

301236 UE UE zur computergestuetzten strukturellen Biologie (2024S)

DK Integrative Structural Biology

2.00 ECTS (2.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
Moodle

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Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Details

max. 15 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

May 6-17, 1 pm - 5 pm
CRC01&02 (VBC4/6.505 & 6.506) in the main Max Perutz building (Dr.-Bohrgasse 9, 1030 Vienna)

Vorbesprechung: 11 am, March 8th 2024, HS B in VBC5 (level 1, Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Vienna)

  • Montag 06.05. 13:00 - 17:00 BZB EDV-Raum CCR01, 6.Ebene 6.505, Dr.-Bohr-Gasse 9, 1030 Wien
  • Dienstag 07.05. 13:00 - 17:00 BZB EDV-Raum CCR01, 6.Ebene 6.505, Dr.-Bohr-Gasse 9, 1030 Wien
  • Mittwoch 08.05. 13:00 - 17:00 BZB EDV-Raum CCR01, 6.Ebene 6.505, Dr.-Bohr-Gasse 9, 1030 Wien
  • Donnerstag 09.05. 13:00 - 17:00 BZB EDV-Raum CCR01, 6.Ebene 6.505, Dr.-Bohr-Gasse 9, 1030 Wien
  • Freitag 10.05. 13:00 - 17:00 BZB EDV-Raum CCR01, 6.Ebene 6.505, Dr.-Bohr-Gasse 9, 1030 Wien
  • Montag 13.05. 13:00 - 17:00 BZB EDV-Raum CCR01, 6.Ebene 6.505, Dr.-Bohr-Gasse 9, 1030 Wien
    BZB EDV-Raum CCR02, 6.Ebene 6.506, Dr.-Bohr-Gasse 9, 1030 Wien
  • Dienstag 14.05. 13:00 - 17:00 BZB EDV-Raum CCR01, 6.Ebene 6.505, Dr.-Bohr-Gasse 9, 1030 Wien
    BZB EDV-Raum CCR02, 6.Ebene 6.506, Dr.-Bohr-Gasse 9, 1030 Wien
  • Mittwoch 15.05. 13:00 - 17:00 BZB EDV-Raum CCR01, 6.Ebene 6.505, Dr.-Bohr-Gasse 9, 1030 Wien
    BZB EDV-Raum CCR02, 6.Ebene 6.506, Dr.-Bohr-Gasse 9, 1030 Wien
  • Donnerstag 16.05. 13:00 - 17:00 BZB EDV-Raum CCR01, 6.Ebene 6.505, Dr.-Bohr-Gasse 9, 1030 Wien
    BZB EDV-Raum CCR02, 6.Ebene 6.506, Dr.-Bohr-Gasse 9, 1030 Wien
  • Freitag 17.05. 13:00 - 17:00 BZB EDV-Raum CCR01, 6.Ebene 6.505, Dr.-Bohr-Gasse 9, 1030 Wien
    BZB EDV-Raum CCR02, 6.Ebene 6.506, Dr.-Bohr-Gasse 9, 1030 Wien

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Aufbauend auf der Vorlesung Computergestuetzte Strukturelle Biologie (301232-1 VO), in diesem Kurs werden die praktischen Techniken fuer die Implementierung und Analyze der Molekulardynamischen Simulationen der Biomolekuele erlernt, und zwar mit Hilfe des Simulationspakets GROMACS. Dieser praktische Kurs ergänzt die theoretischen Vorlesungen in 301232-1 VO Computergestützte Strukturelle Biologie. Die Studierenden müssen diesen oder einen ähnlichen Kurs absolviert haben oder 301232-1 parallel dazu belegen.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Präsentation des Projekts (50% der Note); Praktikumsbericht (50% der Note).

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

a. Mindestanforderung: Für das Erreichen einer positiven Note müssen 50 % der maximal möglichen Punkteanzahl erreicht werden. b. Beurteilungsmassstab - 1 : 90-100%; 2 : 75-89.99%; 3 : 60-74.99%; 4 : 50-59.99%; 5 : 0-49.99%.

Prüfungsstoff

Inahlt der Praktika und ihr theoretischer Hintergrund.

Literatur

Dan Frenkel and Berend Smit: Understanding Molecular Simulation, ISBN ISBN: 9780122673511; Andrew Leach: Molecular Modeling, ISBN-13: 978-0582382107.

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

MMB II., MMEI III, PhD MB 1, PhD MB 2,

Letzte Änderung: Di 16.04.2024 15:46