Universität Wien

301417 VO Methods in Molecular Biology (2023W)

5.00 ECTS (3.00 SWS), SPL 30 - Biologie
VOR-ORT

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Details

Sprache: Englisch

Prüfungstermine

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

ALL lectures are held at the new "Biology Building" - Lecture hall locations t.b.a.
More information will be uploaded to Moodle: https://moodle.univie.ac.at/course/view.php?id=406800

It is very much preferred to attend the lectures physically. We will NOT stream the lectures to increase on-site attendance.
We will record lectures, but will only distribute recordings TWO WEEKS IN ADVANCE OF THE FIRST EXAM DATE (-> End of November) - updated by JG (Sept 29, 2023)

Lecturers and Topics:
1. DNA Repair and Remodeling Methods; includes Noble 2015 topic “DNA Repair”; Dea Slade
2. Next Generation Sequencing 1: Theory and Technologies; Andreas Sommer
3. Next Generation Sequencing 2: Mehtods and Applications; Andreas Sommer
4. Genome editing with a focus on CRISPR Methodology (Noble 2020 Lecture); Krzysztof Chylinski
5. Mass Spectrometry and Advanced Proteomics; Christopher Gerner
6. Membrane Biology and Lipid Biochemistry Methods, including Screening / Lipidomics; Robert Ahrends
7. Light Microscopy Techniques-Applicative Potential; Josef Gotzmann
8. Super-Resolution Microscopy (Noble 2014 topic); Clara Bodner
9. Fluorescence microscopy methods in studies of cellular physiology; includes Noble 2019 topic “Methods to study oxygen sensing”; Ivan Yudushkin
10. Organoids and Developmental Biology Methods; Elly Tanaka
11. Structural Biology & X-ray Crystallography; includes Noble 2017 topic “Cryo-EM”; Gang Dong
12. Methods in Plant Biology; Andreas Bachmair
13. Biochemical Reconstitution Assays; Martin Loose
14. Stem Cell Biology and Genetic Screening; Martin Leeb

NOTE: Since lecture 1 had to be canceled, there is an extra date for the 2nd part of NGS topic on October 19th, 4.45-6.15pm (lecture hall 2 at UBB)!!!

Dienstag 10.10. 15:00 - 16:30 Hörsaal 2, Biologie Djerassiplatz 1, 0.033, Ebene 0
Mittwoch 18.10. 13:15 - 14:45 Hörsaal 2, Biologie Djerassiplatz 1, 0.033, Ebene 0
Donnerstag 19.10. 09:45 - 11:15 Hörsaal 2, Biologie Djerassiplatz 1, 0.033, Ebene 0
Donnerstag 19.10. 16:45 - 18:15 Hörsaal 2, Biologie Djerassiplatz 1, 0.033, Ebene 0
Freitag 20.10. 11:30 - 13:00 Hörsaal 2, Biologie Djerassiplatz 1, 0.033, Ebene 0
Freitag 20.10. 15:00 - 16:30 Hörsaal 2, Biologie Djerassiplatz 1, 0.033, Ebene 0
Dienstag 24.10. 15:00 - 16:30 Hörsaal 2, Biologie Djerassiplatz 1, 0.033, Ebene 0
Mittwoch 25.10. 13:15 - 14:45 Hörsaal 2, Biologie Djerassiplatz 1, 0.033, Ebene 0
Freitag 27.10. 11:30 - 13:00 Hörsaal 2, Biologie Djerassiplatz 1, 0.033, Ebene 0
Freitag 27.10. 15:00 - 16:30 Hörsaal 2, Biologie Djerassiplatz 1, 0.033, Ebene 0
Dienstag 31.10. 15:00 - 16:30 Hörsaal 2, Biologie Djerassiplatz 1, 0.033, Ebene 0
Dienstag 07.11. 15:00 - 16:30 Hörsaal 2, Biologie Djerassiplatz 1, 0.033, Ebene 0
Mittwoch 08.11. 13:15 - 14:45 Hörsaal 2, Biologie Djerassiplatz 1, 0.033, Ebene 0
Donnerstag 09.11. 09:45 - 11:15 Hörsaal 2, Biologie Djerassiplatz 1, 0.033, Ebene 0
Dienstag 14.11. 15:00 - 16:30 Hörsaal 2, Biologie Djerassiplatz 1, 0.033, Ebene 0

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Die Vorlesung behandelt neue und innovative Methoden und spezifische Anwendung in der molekularbiologischen Forschung, und ist als weiterführende Lehrveranstaltung konzipiert, die auf den im Bachelorstudium erhaltenen theoretischen und praktischen Kenntnissen aufbaut. Das heißt grundlegende Kenntnisse von Standardtechniken in der Zellbiologie (z.B.: Zellkultur, Transfektion, PCR, etc) werden vorausgesetzt.Die Inhalte der Vorlesungsreihe werden jährlich adaptiert, um neue Entwicklungen einzubauen. Wesentliche, in der Vorlesung enthaltenen Bereiche, sind: Moderne Anwendungen in Pflanzenbiologie, in der Lichtmikroskopie, Rekonstitutionsanalysen, entwicklungsbiologische Methoden, Genomeditierungsmethoden, Protein-Protein Wechselwirkungen, DNA Reparaturanalysen, Next-Generation Sequencing, strukturbiologische Methoden und dedizierte Verfahren zur Proteinanalyse.
Aufgrund der letztjährigen mäßigen Prüfungsperformance, haben wir uns entschlossen die physische Anwesenheit in den Vorlesungen zu stärken. Wir planen deshalb NICHT, die Vorlesungen per u:Stream aufzuzeichnen. Die Vorlesungen werden aufgezeichnet werden - diese Aufzeichnungen werden aber nicht publiziert. Die für eine Weitergabe von Aufzeichnungen geltenden Regeln werden in den nächsten Tagen bekanntgegeben.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Schriftliche Abschlussprüfung.Prüfungen werden VOR ORT (mit Präsenz) abgehalten. 4 Prüfungstermine sind vorgesehen - zusätzliche Termine bei Bedarf möglich.

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

It is the principle aim of this lecture series to give people advanced in their study an overview on selected techniques and technologies, which are beyond standard textbook knowledge. A series of declared experts and specialists, who also work with these techniques in everyday lab-life, will allow students to get a deeper insight into how profound scientific research is conducted on a methodological level.
@Exam: 6 questions (each from a different topic) - each question 10 points maximum.
The exam questions style is completely free to every lecturer: can contain several sub-questions, can be open questions, multiple choice, single choice or Pick-N-style and also a mixture of question types.
Evaluation key: 1 (Sehr Gut – A): 55,01-60,00
2 (Gut - B): 48,01-55,00
3 (Befriedigend - C): 39,01-48,00
4 (Genügend - D): 30,00-39,00
5 (Nicht Genügend – E / Failed): 00,00-29,99

Prüfungsstoff

The slide contents of the individual lectures is the basis for the exam questions. Any added oral/written comments from the individual lecturers will also be included.

Literatur

shall and will be announced by each lecturer

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

MMB I., MMB III-2, MMB IV-2, MMB IV-3, MMB W-2, MMEI III

Letzte Änderung: Mo 15.04.2024 11:26