Universität Wien

301417 VO Methods in Molecular Biology (2024W)

5.00 ECTS (3.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Moodle
Fr 18.10. 09:45-11:15 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0

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Details

Sprache: Englisch

Prüfungstermine

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

ALL lectures are held at the "Biology Building" - Lecture dates and lecture hall locations-see above.
More information will be uploaded to Moodle: https://moodle.univie.ac.at/course/view.php?id=433162

It is very much preferred to attend the lectures physically. We will NOT STREAM the lectures to increase on-site attendance.
We will record lectures, but will only distribute recordings FOUR WEEKS IN ADVANCE OF THE FIRST EXAM DATE (-> Dec 17/means after the final lecture)

Topics and Lecturers:

1. Next Generation Sequencing 1: Theory and Technologies Alexandra Graf
2. Next Generation Sequencing 2: Single-cell genomics methods, analysis, and applications Florian Halbritter
3. Genome editing with a focus on CRISPR Methodology (Noble 2020 Lecture) Krzysztof Chylinski
4. Structural Biology & X-ray Crystallography; includes Noble 2017 topic “Cryo-EM” Gang Dong
5. Membrane Biology and Lipid Biochemistry Methods, including Screening / Lipidomics Robert Ahrends
6. Fluorescence microscopy methods in studies of cellular physiology; includes Noble 2019 topic “Methods to study oxygen sensing” Ivan Yudushkin
7. Methods in Plant Biology Andreas Bachmair
8. Backup date
9. Light Microscopy Techniques-Applicative Potential Josef Gotzmann
10. Stem Cell Biology and Genetic Screening Martin Leeb
11. Organoids and Developmental Biology Methods. Method of the Year 2023: “In vitro embryo modeling”. Nicolas Rivron
12. DNA Repair and Remodeling Methods; includes Noble 2015 topic “DNA Repair” Dea Slade
13. Super-Resolution Microscopy (Noble 2014 topic) Clara Bodner
14. Mass Spectrometry and Advanced Proteomics Christopher Gerner
15. Biochemical Reconstitution Assays Martin Loose

NOTE: THURSDAY, November 7th is a "Backup Date"!!!

Exam dates: Only the dates for the first two exams are already fixed - for exams 3 and 4 we can only offer the weeks planned:

Exam 1: Tue, Dec 17th 2024 15.00-16.30 HS2 (UBB);
Exam 2: Fri, Jan 22nd 2025 13.15-14.45 HS2 (UBB)
Exam 3: most likely Tue in the week March 10-14, 2025 xx.xx-yy.yy t.b.d. (UBB)
Exam 4: most likely Tue in the week April, 21-25, 2025 xx.xx-yy.yy t.b.d. (UBB)
more details to be announced

Information on Dates (October 1st, 2024):
LECTURE 3, "Genome editing with a focus on CRISPR" by K.Chylinski, originally planned for October 25, WAS RE-SCHEDULED TO NOVEMBER 7, 9h45-11h15 !!!

  • Donnerstag 24.10. 09:45 - 11:15 Hörsaal 2, Biologie Djerassiplatz 1, 0.033, Ebene 0
  • Freitag 25.10. 11:30 - 13:00 Hörsaal 2, Biologie Djerassiplatz 1, 0.033, Ebene 0
  • Mittwoch 30.10. 13:15 - 14:45 Hörsaal 2, Biologie Djerassiplatz 1, 0.033, Ebene 0
  • Donnerstag 31.10. 09:45 - 11:15 Hörsaal 2, Biologie Djerassiplatz 1, 0.033, Ebene 0
  • Dienstag 05.11. 15:00 - 16:35 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
  • Mittwoch 06.11. 13:15 - 14:45 Hörsaal 2, Biologie Djerassiplatz 1, 0.033, Ebene 0
  • Donnerstag 07.11. 09:45 - 11:15 Hörsaal 2, Biologie Djerassiplatz 1, 0.033, Ebene 0
  • Freitag 08.11. 11:30 - 13:00 Hörsaal 2, Biologie Djerassiplatz 1, 0.033, Ebene 0
  • Dienstag 12.11. 15:00 - 16:30 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
  • Mittwoch 13.11. 13:15 - 14:45 Hörsaal 2, Biologie Djerassiplatz 1, 0.033, Ebene 0
  • Donnerstag 14.11. 09:45 - 11:15 Hörsaal 2, Biologie Djerassiplatz 1, 0.033, Ebene 0
  • Freitag 15.11. 09:45 - 11:15 Hörsaal 1, Biologie Djerassiplatz 1, 0.037, Ebene 0
  • Mittwoch 20.11. 13:15 - 14:45 Hörsaal 2, Biologie Djerassiplatz 1, 0.033, Ebene 0
  • Donnerstag 21.11. 09:45 - 11:15 Hörsaal 2, Biologie Djerassiplatz 1, 0.033, Ebene 0

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Die Vorlesung behandelt neue und innovative Methoden und spezifische Anwendung in der molekularbiologischen Forschung, und ist als weiterführende Lehrveranstaltung konzipiert, die auf den im Bachelorstudium erhaltenen theoretischen und praktischen Kenntnissen aufbaut. Das heißt grundlegende Kenntnisse von Standardtechniken in der Zellbiologie (z.B.: Zellkultur, Transfektion, PCR, etc) werden vorausgesetzt.Die Inhalte der Vorlesungsreihe werden jährlich adaptiert, um neue Entwicklungen einzubauen. Wesentliche, in der Vorlesung enthaltenen Bereiche, sind: Moderne Anwendungen in Pflanzenbiologie, in der Lichtmikroskopie, Rekonstitutionsanalysen, entwicklungsbiologische Methoden, Genomeditierungsmethoden, Protein-Protein Wechselwirkungen, DNA Reparaturanalysen, Next-Generation Sequencing, strukturbiologische Methoden und dedizierte Verfahren zur Proteinanalyse.
Aufgrund der letztjährigen mäßigen Prüfungsperformance, haben wir uns entschlossen, die physische Anwesenheit in den Vorlesungen zu stärken. Wir planen deshalb NICHT, die Vorlesungen per u:Stream aufzuzeichnen. Die Vorlesungen werden aber aufgezeichnet werden - diese Aufzeichnungen werden aber erst nach Abschluß der Vorlesungsreihe veröffentlicht.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Schriftliche Abschlussprüfung.Prüfungen werden VOR ORT (mit Präsenz) abgehalten. 4 Prüfungstermine sind vorgesehen - zusätzliche Termine bei Bedarf möglich.

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

It is the principle aim of this lecture series to give people advanced in their study an overview on selected techniques and technologies, which are beyond standard textbook knowledge. A series of declared experts and specialists, who also work with these techniques in everyday lab-life, will allow students to get a deeper insight into how profound scientific research is conducted on a methodological level.
@Exam: 6 questions (each from a different topic) - each question 10 points maximum.
The exam questions style is completely free to every lecturer: can contain several sub-questions, can be open questions, multiple choice, single choice or Pick-N-style and also a mixture of question types.
Evaluation key: 1 (Sehr Gut – A): 55,01-60,00
2 (Gut - B): 48,01-55,00
3 (Befriedigend - C): 39,01-48,00
4 (Genügend - D): 30,00-39,00
5 (Nicht Genügend – E / Failed): 00,00-29,99

Prüfungsstoff

The slide contents of the individual lectures is the basis for the exam questions. Any added oral/written comments from the individual lecturers will also be included.

Literatur

shall and will be announced by each lecturer

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

MMB I., MMEI III

Letzte Änderung: Di 01.10.2024 12:27