Universität Wien

301484 UE Practical Course in Molecular Microbiology, Microbial Ecology and Immunobiology (2023W)

Diversity and function of uncultured microbes in medical and environmental samples

10.00 ECTS (6.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
VOR-ORT

Für diese LV wird eine verpflichtende Sicherheitsunterweisung stattfinden. Nach Ablauf der Anmeldephase und Aufnahme der Studierenden, können die entsprechenden Module (Inhalte und Prüfung) über Moodle geöffnet und absolviert werden. Näheres erfahren Sie unter https://laborlehre-ubb.univie.ac.at/fuer-studierende/

Alle Übungsräume dürfen ausschließlich mit Labormantel und geschlossenen Schuhen betreten werden, ebenso muss eine Laborbrille angeschafft werden - Privatsachen bitte in den Garderoberäumen verstauen.

There will be a mandatory safty instruction for this course. After the registration period, the admitted students can open and complete the respective modules (content and exam) via Moodle.You can find out more at https://laborlehre-ubb.univie.ac.at/fuer-studierende/

All practice rooms may only be entered with a lab coat and closed shoes, and lab glasses must also be purchased - please store private belongings in the cloakroom.
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An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Details

max. 14 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

A preparatory meeting for the course will take place on the 29th of January at 1 pm via Zoom.

The course will run from February 19th to March 1st (Monday-Friday) from 9:00 am to 5:00 pm.

Montag 19.02. 08:00 - 18:15 Seminarraum 1.5, Biologie Djerassiplatz 1, 1.012, Ebene 1
Übungsraum 1.8 Molekularbiologie 2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.040, Ebene 1
Dienstag 20.02. 08:00 - 18:15 Seminarraum 1.5, Biologie Djerassiplatz 1, 1.012, Ebene 1
Übungsraum 1.8 Molekularbiologie 2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.040, Ebene 1
Mittwoch 21.02. 08:00 - 18:15 Seminarraum 1.5, Biologie Djerassiplatz 1, 1.012, Ebene 1
Übungsraum 1.8 Molekularbiologie 2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.040, Ebene 1
Donnerstag 22.02. 08:00 - 18:15 Seminarraum 1.5, Biologie Djerassiplatz 1, 1.012, Ebene 1
Übungsraum 1.8 Molekularbiologie 2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.040, Ebene 1
Freitag 23.02. 08:00 - 18:15 Seminarraum 1.5, Biologie Djerassiplatz 1, 1.012, Ebene 1
Übungsraum 1.8 Molekularbiologie 2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.040, Ebene 1
Montag 26.02. 08:00 - 18:15 Seminarraum 1.5, Biologie Djerassiplatz 1, 1.012, Ebene 1
Übungsraum 1.8 Molekularbiologie 2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.040, Ebene 1
Dienstag 27.02. 08:00 - 18:15 Seminarraum 1.5, Biologie Djerassiplatz 1, 1.012, Ebene 1
Übungsraum 1.8 Molekularbiologie 2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.040, Ebene 1
Mittwoch 28.02. 08:00 - 18:15 Seminarraum 1.5, Biologie Djerassiplatz 1, 1.012, Ebene 1
Übungsraum 1.8 Molekularbiologie 2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.040, Ebene 1
Donnerstag 29.02. 08:00 - 18:15 Seminarraum 1.5, Biologie Djerassiplatz 1, 1.012, Ebene 1
Übungsraum 1.8 Molekularbiologie 2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.040, Ebene 1
Freitag 01.03. 08:00 - 18:15 Seminarraum 1.5, Biologie Djerassiplatz 1, 1.012, Ebene 1
Übungsraum 1.8 Molekularbiologie 2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.040, Ebene 1

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Course goals: In this course you will learn modern methods fur studying microorganisms without cultivation, including how to identify microorganisms and visualize them directly in environmental samples and how to study the activity and function of organisms in complex microbial communities.

Places in the course will be assigned based on the set points, the requirements of the different master programs and waiting time.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Art der Leistungskontrolle: Benotung beruht auf drei Teilleistungen: praktische Arbeit im Labor, Seminar, und schriftliches Protokoll. Die erfolgreiche Absolvierung der LV erfordert positive Beurteilungen für alle drei Teilleistungen.

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Active participation in lab experiments and seminar (incl. presentation), as well as written protocol.

Prüfungsstoff

Methods: Theoretical knowledge will be disseminated through lectures (PowerPoint Presentations), the course handout and original literature. Supervised hands-on training in independent experiments will teach you how to identify microorganisms through 16S rRNA gene/transcript analysis and fluorescence in situ hybridization techniques (FISH/ CARD-FISH). You will further learn about the use of functional genes/transcripts to identify microorganisms involved in a certain function, and how to investigate their activity with stable isotope probing incubations. The theoretical principles of high-resolution secondary ion mass spectrometry (NanoSIMS) and Raman microspectroscopy coupled to stable isotope incubations will also be discussed.
The course includes computer-based sequence analysis as well as presentations and discussion of the results in student seminars.

Literatur

Literature will be provided during the course.

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

MMEI I

Letzte Änderung: Mo 13.11.2023 10:09