Universität Wien

301590 VU Grundlagen der Bioinformatik (2022W)

5.00 ECTS (3.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
VOR-ORT
Moodle

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Details

max. 130 Teilnehmer*innen
Sprache: Deutsch

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

Wöchentlich Mo 08.00-11.15 Uhr
Erster Termin 10.10.2022

Siehe auch Studentenseite der Departments:
http://molekularebiologie.univie.ac.at/
Voraussetzungen sind: 301628 Vo Mathematik und die 301629 UE Mathematik

  • Montag 10.10. 08:00 - 11:15 Hörsaal 2 Eduard Suess, 2A122 1.OG UZA II Geo-Zentrum
  • Montag 17.10. 08:00 - 11:15 Hörsaal 2 Eduard Suess, 2A122 1.OG UZA II Geo-Zentrum
  • Montag 24.10. 08:00 - 11:15 Hörsaal 2 Eduard Suess, 2A122 1.OG UZA II Geo-Zentrum
  • Montag 31.10. 08:00 - 11:15 Hörsaal 2 Eduard Suess, 2A122 1.OG UZA II Geo-Zentrum
  • Montag 07.11. 08:00 - 11:15 Hörsaal 2 Eduard Suess, 2A122 1.OG UZA II Geo-Zentrum
  • Montag 14.11. 08:00 - 11:15 Hörsaal 2 Eduard Suess, 2A122 1.OG UZA II Geo-Zentrum
  • Montag 21.11. 08:00 - 11:15 Hörsaal 2 Eduard Suess, 2A122 1.OG UZA II Geo-Zentrum
  • Montag 28.11. 08:00 - 11:15 Hörsaal 2 Eduard Suess, 2A122 1.OG UZA II Geo-Zentrum
  • Montag 05.12. 08:00 - 11:15 Hörsaal 2 Eduard Suess, 2A122 1.OG UZA II Geo-Zentrum
  • Montag 12.12. 08:00 - 11:15 Hörsaal 2 Eduard Suess, 2A122 1.OG UZA II Geo-Zentrum
  • Montag 09.01. 08:00 - 11:15 Hörsaal 2 Eduard Suess, 2A122 1.OG UZA II Geo-Zentrum
  • Montag 16.01. 08:00 - 11:15 Hörsaal 2 Eduard Suess, 2A122 1.OG UZA II Geo-Zentrum
  • Montag 23.01. 08:00 - 11:15 Hörsaal 2 Eduard Suess, 2A122 1.OG UZA II Geo-Zentrum
  • Montag 30.01. 08:00 - 11:15 Hörsaal 2 Eduard Suess, 2A122 1.OG UZA II Geo-Zentrum

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Einführung in die grundlegenden Algorithmen der Bioinformatik mit
Schwerpunkt auf Sequenzanalyse.
Sequenzähnlichkeit; Dynamische Programmierung; Alignmentalgorithmen wie
Needleman-Wunsch, Smith-Waterman und Gotoh, BLAST und FASTA;
Multiple Sequenzalignments; Clustering und
Phylogenierekonstruktion; RNA Sekundärstrukturen.
Lernbehelf: Vorlesungsunterlagen
Beurteilung: Hausübungen und Prüfungen

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Hausübungen und 2 schriftliche Prüfungen
Erlaute Hilfsmittel bei Prüfungen: Taschenrechner

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Verständnis grundlegender Methoden der Sequenzanalyse, sowie
ausgewählter Algorithmen und Methoden aus dem Bereich der Phylogenierekonstruktion und Strukturvorhersage.
Beurteilungsmaßstab: gewichtetes Mittel von Noten auf Hausübungen und Prüfungen.

Prüfungsstoff

Inhalt der Vorlesungen und Folien

Literatur

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

BMB 7, BMG 7

Letzte Änderung: Do 31.10.2024 00:18