301590 VU Grundlagen der Bioinformatik (2022W)

Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung

VOR-ORT

Moodle

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Anmeldung von Do 08.09.2022 14:00 bis Do 22.09.2022 18:00
Abmeldung bis Do 22.09.2022 18:00

Details

max. 130 Teilnehmer*innen

Sprache: Deutsch

Lehrende

Ivo Hofacker

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

Wöchentlich Mo 08.00-11.15 Uhr
Erster Termin 10.10.2022

Siehe auch Studentenseite der Departments:
http://molekularebiologie.univie.ac.at/
Voraussetzungen sind: 301628 Vo Mathematik und die 301629 UE Mathematik

    
    Montag
    10.10.
    08:00 - 11:15
    Hörsaal 2 Eduard Suess, 2A122 1.OG UZA II Geo-Zentrum
    
    Montag
    17.10.
    08:00 - 11:15
    Hörsaal 2 Eduard Suess, 2A122 1.OG UZA II Geo-Zentrum
    
    Montag
    24.10.
    08:00 - 11:15
    Hörsaal 2 Eduard Suess, 2A122 1.OG UZA II Geo-Zentrum
    
    Montag
    31.10.
    08:00 - 11:15
    Hörsaal 2 Eduard Suess, 2A122 1.OG UZA II Geo-Zentrum
    
    Montag
    07.11.
    08:00 - 11:15
    Hörsaal 2 Eduard Suess, 2A122 1.OG UZA II Geo-Zentrum
    
    Montag
    14.11.
    08:00 - 11:15
    Hörsaal 2 Eduard Suess, 2A122 1.OG UZA II Geo-Zentrum
    
    Montag
    21.11.
    08:00 - 11:15
    Hörsaal 2 Eduard Suess, 2A122 1.OG UZA II Geo-Zentrum
    
    Montag
    28.11.
    08:00 - 11:15
    Hörsaal 2 Eduard Suess, 2A122 1.OG UZA II Geo-Zentrum
    
    Montag
    05.12.
    08:00 - 11:15
    Hörsaal 2 Eduard Suess, 2A122 1.OG UZA II Geo-Zentrum
    
    Montag
    12.12.
    08:00 - 11:15
    Hörsaal 2 Eduard Suess, 2A122 1.OG UZA II Geo-Zentrum
    
    Montag
    09.01.
    08:00 - 11:15
    Hörsaal 2 Eduard Suess, 2A122 1.OG UZA II Geo-Zentrum
    
    Montag
    16.01.
    08:00 - 11:15
    Hörsaal 2 Eduard Suess, 2A122 1.OG UZA II Geo-Zentrum
    
    Montag
    23.01.
    08:00 - 11:15
    Hörsaal 2 Eduard Suess, 2A122 1.OG UZA II Geo-Zentrum
    
    Montag
    30.01.
    08:00 - 11:15
    Hörsaal 2 Eduard Suess, 2A122 1.OG UZA II Geo-Zentrum

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Einführung in die grundlegenden Algorithmen der Bioinformatik mit
Schwerpunkt auf Sequenzanalyse.
Sequenzähnlichkeit; Dynamische Programmierung; Alignmentalgorithmen wie
Needleman-Wunsch, Smith-Waterman und Gotoh, BLAST und FASTA;
Multiple Sequenzalignments; Clustering und
Phylogenierekonstruktion; RNA Sekundärstrukturen.
Lernbehelf: Vorlesungsunterlagen
Beurteilung: Hausübungen und Prüfungen

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Hausübungen und 2 schriftliche Prüfungen
Erlaute Hilfsmittel bei Prüfungen: Taschenrechner

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Verständnis grundlegender Methoden der Sequenzanalyse, sowie
ausgewählter Algorithmen und Methoden aus dem Bereich der Phylogenierekonstruktion und Strukturvorhersage.
Beurteilungsmaßstab: gewichtetes Mittel von Noten auf Hausübungen und Prüfungen.

Prüfungsstoff

Inhalt der Vorlesungen und Folien

Literatur

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

BMB 7, BMG 7

Letzte Änderung: Fr 30.09.2022 11:50