Universität Wien

301590 VU Grundlagen der Bioinformatik (2023W)

5.00 ECTS (3.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
VOR-ORT
Moodle

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Details

max. 130 Teilnehmer*innen
Sprache: Deutsch

Lehrende

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  • Montag 02.10. 08:00 - 13:00 Hörsaal 31 Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
  • Montag 09.10. 08:00 - 13:00 Hörsaal 31 Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
  • Montag 16.10. 08:00 - 13:00 Hörsaal 31 Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
  • Montag 23.10. 08:00 - 13:00 Hörsaal 31 Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
  • Montag 30.10. 08:00 - 13:00 Hörsaal 31 Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
  • Montag 06.11. 08:00 - 13:00 Hörsaal 31 Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
  • Montag 13.11. 08:00 - 13:00 Hörsaal 31 Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
  • Montag 20.11. 08:00 - 13:00 Hörsaal 31 Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
  • Montag 27.11. 08:00 - 13:00 Hörsaal 31 Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
  • Montag 04.12. 08:00 - 13:00 Hörsaal 31 Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
  • Montag 11.12. 08:00 - 13:00 Hörsaal 31 Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
  • Montag 08.01. 08:00 - 13:00 Hörsaal 31 Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
  • Montag 15.01. 08:00 - 13:00 Hörsaal 31 Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
  • Montag 22.01. 08:00 - 13:00 Hörsaal 31 Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
  • Montag 29.01. 08:00 - 13:00 Hörsaal 31 Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Einführung in die grundlegenden Algorithmen der Bioinformatik mit
Schwerpunkt auf Sequenzanalyse.
Sequenzähnlichkeit; Dynamische Programmierung; Alignmentalgorithmen wie
Needleman-Wunsch, Smith-Waterman und Gotoh, BLAST und FASTA;
Multiple Sequenzalignments; Clustering und
Phylogenierekonstruktion; RNA Sekundärstrukturen.
Lernbehelf: Vorlesungsunterlagen
Beurteilung: Hausübungen und Prüfungen

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Hausübungen und 2 schriftliche Prüfungen
Erlaubte Hilfsmittel bei Prüfungen: Taschenrechner

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Verständnis grundlegender Methoden der Sequenzanalyse, sowie
ausgewählter Algorithmen und Methoden aus dem Bereich der Phylogenierekonstruktion und Strukturvorhersage.
Beurteilungsmaßstab: gewichtetes Mittel von Noten auf Hausübungen und Prüfungen.

Prüfungsstoff

Inhalt der Vorlesungen und Folien

Literatur

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

BMB 7, BMG 7

Letzte Änderung: Mo 07.08.2023 16:28