301590 VU Grundlagen der Bioinformatik (2023W)

Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung

VOR-ORT

Moodle

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Anmeldung von Do 07.09.2023 14:00 bis Do 21.09.2023 18:00
Abmeldung bis Do 21.09.2023 18:00

Details

max. 130 Teilnehmer*innen

Sprache: Deutsch

Lehrende

Ivo Hofacker

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

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    Montag
    02.10.
    08:00 - 13:00
    Hörsaal 31  Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
    
    Montag
    09.10.
    08:00 - 13:00
    Hörsaal 31  Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
    
    Montag
    16.10.
    08:00 - 13:00
    Hörsaal 31  Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
    
    Montag
    23.10.
    08:00 - 13:00
    Hörsaal 31  Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
    
    Montag
    30.10.
    08:00 - 13:00
    Hörsaal 31  Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
    
    Montag
    06.11.
    08:00 - 13:00
    Hörsaal 31  Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
    
    Montag
    13.11.
    08:00 - 13:00
    Hörsaal 31  Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
    
    Montag
    20.11.
    08:00 - 13:00
    Hörsaal 31  Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
    
    Montag
    27.11.
    08:00 - 13:00
    Hörsaal 31  Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
    
    Montag
    04.12.
    08:00 - 13:00
    Hörsaal 31  Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
    
    Montag
    11.12.
    08:00 - 13:00
    Hörsaal 31  Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
    
    Montag
    08.01.
    08:00 - 13:00
    Hörsaal 31  Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
    
    Montag
    15.01.
    08:00 - 13:00
    Hörsaal 31  Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
    
    Montag
    22.01.
    08:00 - 13:00
    Hörsaal 31  Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
    
    Montag
    29.01.
    08:00 - 13:00
    Hörsaal 31  Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Einführung in die grundlegenden Algorithmen der Bioinformatik mit
Schwerpunkt auf Sequenzanalyse.
Sequenzähnlichkeit; Dynamische Programmierung; Alignmentalgorithmen wie
Needleman-Wunsch, Smith-Waterman und Gotoh, BLAST und FASTA;
Multiple Sequenzalignments; Clustering und
Phylogenierekonstruktion; RNA Sekundärstrukturen.
Lernbehelf: Vorlesungsunterlagen
Beurteilung: Hausübungen und Prüfungen

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Hausübungen und 2 schriftliche Prüfungen
Erlaubte Hilfsmittel bei Prüfungen: Taschenrechner

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Verständnis grundlegender Methoden der Sequenzanalyse, sowie
ausgewählter Algorithmen und Methoden aus dem Bereich der Phylogenierekonstruktion und Strukturvorhersage.
Beurteilungsmaßstab: gewichtetes Mittel von Noten auf Hausübungen und Prüfungen.

Prüfungsstoff

Inhalt der Vorlesungen und Folien

Literatur

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

BMB 7, BMG 7

Letzte Änderung: Mo 07.08.2023 16:28