Universität Wien

301598 SE Forschungsdatenmanagement in den Lebenswissenschaften (2024S)

1.00 ECTS (1.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
Moodle

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Details

max. 24 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

Das Seminar findet alle 14 Tage von 10:00 bis 11:15 Uhr im Seminarraum 1.2 des UBB statt:
5.3. (Vorbesprechung 10 Uhr in Moodle)
16.4.
23.4.
7.5.
21.5.
4.6.
18.6.

  • Dienstag 05.03. 09:45 - 11:15 Seminarraum 1.2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.004, Ebene 1
  • Dienstag 19.03. 09:45 - 11:15 Seminarraum 1.2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.004, Ebene 1
  • Dienstag 09.04. 09:45 - 11:15 Seminarraum 1.2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.004, Ebene 1
  • Dienstag 16.04. 09:45 - 11:15 Seminarraum 1.2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.004, Ebene 1
  • Dienstag 23.04. 09:45 - 11:15 Seminarraum 1.2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.004, Ebene 1
  • Dienstag 30.04. 09:45 - 11:15 Seminarraum 1.2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.004, Ebene 1
  • Dienstag 07.05. 09:45 - 11:15 Seminarraum 1.2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.004, Ebene 1
  • Dienstag 14.05. 09:45 - 11:15 Seminarraum 1.2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.004, Ebene 1
  • Dienstag 21.05. 09:45 - 11:15 Seminarraum 1.2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.004, Ebene 1
  • Dienstag 28.05. 09:45 - 11:15 Seminarraum 1.2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.004, Ebene 1
  • Dienstag 04.06. 09:45 - 11:15 Seminarraum 1.2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.004, Ebene 1
  • Dienstag 11.06. 09:45 - 11:15 Seminarraum 1.2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.004, Ebene 1
  • Dienstag 18.06. 09:45 - 11:15 Seminarraum 1.2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.004, Ebene 1
  • Dienstag 25.06. 09:45 - 11:15 Seminarraum 1.2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.004, Ebene 1

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

The students are able to explain objectives and methods of research data management. The students are able to select and use computational tools for data management and reproducible data processing.
Main topics:
- Research data management
- Repositories (e.g. GitHub)
- Workflow languages (e.g., snakemake, nextflow)
- Containers (e.g., Docker, Singularity)

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Students actively participate in the seminar discussions. Students prepare one presentation. Students work on exercise assignments in groups.

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Three successful submissions of exercise assignments.

Prüfungsstoff

What is Research Data Management (RDM)?
Data management plans
Organization of data
Documentation and annotation of data
Storing and securing of data
Publishing and archiving of data
Ethical and legal aspects of RDM
Techniques for reproducible computational analysis
Software repositories
Workflow languages
Software containers

Literatur

Will be provided during the seminar.

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

MMB II., MMEI II-1.2, MMEI II-2.2, MNEU V.

Letzte Änderung: Mo 15.07.2024 13:26