301845 UE Practical Course in Molecular Microbiology, Microbial Ecology and Immunobiology 1 (2018S)

Im Rahmen dieser Übung sollen die Stundenten anhand heute gängiger Methoden unbekannte Bakterienisolate klassifizieren und gegebenenfalls auch identifzieren. Das dabei angewandte Methodenspektrum umfasst a) klassische Methoden wie Gram-Färbung, Test auf Oxidase, und Katalase, Substratverwertung und Säurebildung aus Zuckern; b) Methoden der Chemotaxonomie wie Analyse der Chinone, polaren Lipide, Mycolsäuren, Zellwanddiaminosäuren und Polyamine sowie Vergleich von Proteinmustern; c) Methoden der Molekularbiologie wie genotypische 'Fingerabrücke' nach ERIC-, REP- und BOX-PCR, Amplifizierung von 16S rDNA mit nachfolgendem Verdau mit einem Restriktionsenzym (ARDRA) sowie Größenvergleich der DNA Fragmente nach PCR-Amplifizierung des 16S-23S 'interspacer' Bereichs (ITS). Basierend auf der Summe der erhaltenen Ergebnisse werden die Bakterien dann über Vergleich mit Literaturdaten den jeweiligen Genera und gegebenenfalls auch Spezies zugeordnet.