301845 UE Practical Course in Molecular Microbiology (2019S)

Im Rahmen dieser Übung sollen die Stundenten anhand heute gängiger Methoden unbekannte Bakterienisolate klassifizieren und gegebenenfalls auch identifzieren. Das dabei angewandte Methodenspektrum umfasst a) klassische Methoden wie Gram-Färbung, Test auf Oxidase, und Katalase, Substratverwertung und Säurebildung aus Zuckern; b) Methoden der Chemotaxonomie wie Analyse der Chinone, polaren Lipide, Mycolsäuren, Zellwanddiaminosäuren und Polyamine sowie Vergleich von Proteinmustern; c) Methoden der Molekularbiologie wie genotypische 'Fingerabrücke' nach ERIC-, REP- und BOX-PCR, Amplifizierung von 16S rDNA mit nachfolgendem Verdau mit einem Restriktionsenzym (ARDRA) sowie Größenvergleich der DNA Fragmente nach PCR-Amplifizierung des 16S-23S 'interspacer' Bereichs (ITS). Basierend auf der Summe der erhaltenen Ergebnisse werden die Bakterien dann über Vergleich mit Literaturdaten den jeweiligen Genera und gegebenenfalls auch Spezies zugeordnet.