310001 SE Projekt- und Versuchsplanung im SPF Mikrob./Immun. (2005W)
Projekt- und Versuchsplanung im SPF Mikrobiologie/Immunologie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
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Ort: BZB, EDV-Schulungsraum, Dr. Bohrgasse 9, 1030 Wien.
Weitere Infos auf der Studentenseite des Departments: http://www.univie.ac.at/gem
Zu Absolvieren in Kombination mit einer Übung im SPF Mikrobiologie/Immunologie, Online-Anmeldung
Weitere Infos auf der Studentenseite des Departments: http://www.univie.ac.at/gem
Zu Absolvieren in Kombination mit einer Übung im SPF Mikrobiologie/Immunologie, Online-Anmeldung
Details
Information
Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung
Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel
Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab
Prüfungsstoff
Literatur
Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis
M204
Letzte Änderung: Fr 31.08.2018 08:57
Inhalt:Die Lehrveranstaltung vermittelt Grundlagen über den Computereinsatz in der modernen molekularbiologischen Forschung: Suche, Herunterladen und Analyse von DNA- und Protein-Sequenzen unter Einsatz lokaler und Internet-basierender Ressourcen.
Voraussetzungen: allgemeine EDV Kenntnisse und Übung III A: Molekularbiologische Laborarbeiten
Beschränkte Teilnehmerzahl, max. 12/ParallelkursProgramm:
Sequenzanalysen (DNA):
- Primärstruktur
- sequence assembly
- Sequenzvergleich
- StatistikSequenzanalyse (Protein):
- Primärstruktur (diverse EMBOSS Programme, Internet)
- Sequenzvergleich, Homologiesuche (Fasta, Blast, needle, dotplot, ...)
- Sekundärstruktur (beta-Faltblatt, alpha-Helix, helix-turn-helix....)
- Statistik (diverse EMBOSS Programme, Internet)
- Domänensuche (Prosite, Blast)
- multiple sequence alignement (emma, Clustal)Datenbanken und Internetserver (z.B.):
- Genbank
- EMBL
- PDB
- Pubmed
- NCBI
- EBI
- ExpasyPlasmid-Klonierung "in silico"