570001 WS Workshop Computational Metagenomics (2021S)
2.00 ECTS (1.00 SWS), SPL 57 - Doktoratsstudium Biologie mit Schwerpunkt Mikrobiologie und Umweltsyste
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
Labels
An/Abmeldung
Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").
- Anmeldung von Do 11.02.2021 08:00 bis Do 25.02.2021 18:00
- Abmeldung bis Mi 31.03.2021 18:00
Details
max. 20 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch
Lehrende
Termine
29.03.-02.04.21, afternoon each day
Information
Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung
Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel
Individual work on projects
Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab
The workshop targets Phd Students who use genomic and metagenomic methods.
Prüfungsstoff
Literatur
Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis
Letzte Änderung: Mo 22.03.2021 11:50
Day 1: Metagenomic concepts, Sequencing types, Brief intros into projects
Day 2: Metagenomic programs and assembly, Server access and basics , Intro into how to assemble metagenomes
Day 3: uBin
Day 4: Anvi'o binning, Anvi'o , above and beyond
Day 5: Taxonomy, phylogeny, diversity , Gene calling and annotation, phenDB