570002 WS Data Management in Bioinformatics (2021W)
3.00 ECTS (1.50 SWS), SPL 57 - Doktoratsstudium Biologie mit Schwerpunkt Mikrobiologie und Umweltsyste
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
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DIGITAL
An/Abmeldung
Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").
- Anmeldung von Do 09.09.2021 08:00 bis Do 23.09.2021 18:00
- Abmeldung bis So 31.10.2021 18:00
Details
max. 15 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch
Lehrende
Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert
Begin: 10.11.2021, 9:00 a.m.
10.11.2021, 9:00 - 16:00 The course will be held in-person if possible.
11.11.2021, 9:00 - 16:00 The course will be held in-person if possible.
12.11.2021, 9:00 - 16:00 The course will be held in-person if possible.
Mittwoch
10.11.
09:00 - 15:55
Seminarraum 2.1, Biologie Djerassiplatz 1, 2.129, Ebene 2
Freitag
12.11.
09:00 - 16:00
Seminarraum 2.1, Biologie Djerassiplatz 1, 2.129, Ebene 2
Information
Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung
Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel
Active and continuous participation in class.
Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab
Presence and participation is mandatory.Prerequisites: A basic understanding of bioinformatic work (ssh, Linux, bash) is required to join this class. An ssh client is required on the student’s computer. Bring your laptop.
Prüfungsstoff
There will be no exam. Evaluation is based on participation in class.
Literatur
Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis
PhD
Letzte Änderung: Di 24.01.2023 00:31
- Command line (bash) tips and tricks
- Code and data management using the version control software git and website GitHub
- Reproducibility and documentation of analyses (e.g. R markdown, Jupyter Notebook, snakemake)