Universität Wien

040775 UK Biometrics 2 (2021W)

3.00 ECTS (2.00 SWS), SPL 4 - Wirtschaftswissenschaften
Continuous assessment of course work
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Details

max. 30 participants
Language: German

Lecturers

Classes (iCal) - next class is marked with N

  • Friday 01.10. 08:00 - 09:30 Digital
  • Friday 08.10. 08:00 - 09:30 Digital
  • Friday 15.10. 08:00 - 09:30 Digital
  • Friday 22.10. 08:00 - 09:30 Digital
  • Friday 29.10. 08:00 - 09:30 Digital
  • Friday 05.11. 08:00 - 09:30 Digital
  • Friday 12.11. 08:00 - 09:30 Digital
  • Friday 19.11. 08:00 - 09:30 Digital
  • Friday 26.11. 08:00 - 09:30 Digital
  • Friday 03.12. 08:00 - 09:30 Digital
  • Friday 10.12. 08:00 - 09:30 Digital
  • Friday 17.12. 08:00 - 09:30 Digital
  • Friday 07.01. 08:00 - 09:30 Digital
  • Friday 14.01. 08:00 - 09:30 Digital
  • Friday 21.01. 08:00 - 09:30 Digital
  • Friday 28.01. 08:00 - 09:30 Digital

Information

Aims, contents and method of the course

Generell: Bayes'sche Statistik mit Beispielen aus der Biologie und einem Schwerpunkt auf der Errechnung von a-posteriori Wahrscheinlichkeiten.

Im Detail: 1) Einführung in die Bayes'sche Statistik mit Beispielen aus der Genetik.
2) Standardverteilungen und deren konjugierte Verteilungen, ebenfalls mit Beispielen aus der Biologie: Binomialverteilung mit der konjugierten Betaverteilung; Poissonverteilung mit der konjugierten Gammaverteilung; Exponentialverteilung mit der konjugierten Gammverteilung; Normalverteilung mit der Normal-invers-Chiquadratverteilung.
3) empirische Bayes Methode.
4) Bayes'sche Netzwerke, wo die bedingten Abhängigkeiten der Unbekannten durch einen gerichteten azyklischen Pfad dargestellt werden können; hidden-Markov-Modelle als Beispiel dafür (mit Beispielen aus der Mendelgenetik), mit dem Vorwärts-Rückwärts Algorithmus (eine dynamische Programmiermethode) als numerischer Methode um Wahrscheinlichkeiten auszurechnen. 5) kompliziertere Modelle, bei denen dynamisches Programmieren nicht mehr möglich ist (ebenfalls mit vielen biologischen Beispielen). Numerische Methoden: Monte-Carlo Markovketten (Metropolis, Gibbs und Metropolis-Hastings) Algorithmen sowie Expectation-Maximization (EM) Algorithmen.

Assessment and permitted materials

Begleitende Hausübungsbeispiele unterschiedlichen Schwierigkeitsgrads und Umfangs; beides ist in den erreichbaren Punkten pro Beispiel abgebildet.

Minimum requirements and assessment criteria

Werden mehr als die Hälfte der Punkte erreicht, ergibt sich eine positive Note.

Examination topics

Vorlesungstoff

Reading list

Durbin, R., Eddy, S., Krogh, A., and Mitchison, G. (1998). Biological sequence analysis.
Cambridge University Press, Cambridge.

Gelman, A., Carlin, J., Stern, H., and Rubin, D. (1995). Bayesian Data Analysis. Chapman
& Hall.

Association in the course directory

Last modified: Fr 12.05.2023 00:13