Universität Wien FIND

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053522 VU Bioinformatics for phylogeny and evolutionary tree reconstruction (2019W)

Continuous assessment of course work

Registration/Deregistration

Note: The time of your registration within the registration period has no effect on the allocation of places (no first come, first served).

Details

max. 25 participants
Language: English

Lecturers

Classes (iCal) - next class is marked with N

VB: DO 03.10.2019 10.00-12.00; DO wtl von 03.10.2019 bis 30.01.2020 10.00-12.00 Ort: Seminarraum Strukturchemie, Ebene 1, Campus Vienna Biocenter 5 (VBC5), 1030 Wien

Thursday 03.10. 10:00 - 12:00 extern
Thursday 10.10. 10:00 - 12:00 extern
Thursday 17.10. 10:00 - 12:00 extern
Thursday 24.10. 10:00 - 12:00 extern
Thursday 31.10. 10:00 - 12:00 extern
Thursday 07.11. 10:00 - 12:00 extern
Thursday 14.11. 10:00 - 12:00 extern
Thursday 21.11. 10:00 - 12:00 extern
Thursday 28.11. 10:00 - 12:00 extern
Thursday 05.12. 10:00 - 12:00 extern
Thursday 12.12. 10:00 - 12:00 extern
Thursday 09.01. 10:00 - 12:00 extern
Thursday 16.01. 10:00 - 12:00 extern
Thursday 23.01. 10:00 - 12:00 extern
Thursday 30.01. 10:00 - 12:00 extern

Information

Aims, contents and method of the course

This lecture gives a wide overview about the bioinformatics of phylogenetics and evolutionary tree reconstruction in theory and practice.
It covers topics like: historical background; theoretical basics and definitions; different approaches like maximum parsimony, distance methods, maximum likelihood and Bayesian and associated algorithms; tree search and tree rearrangements; models of sequence evolution and model selection; summarizing trees and branch support; tree topology testing; tracing phylogenetic signal and noise; phylogenomics, supertrees and partition models.
Finally, the includes two hands-on units applying phylogenetic software.

Assessment and permitted materials

Die Beurteilung dieser prüfungsimmanenten Veranstaltung setzt sich aus den folgenden Leistungsnachweisen zusammen:
Zu den Vorlesungen sind gelöste Übungsaufgaben abzugeben. Für die Übungsaufgaben werden Punkte vergeben. Zum Bestehen der Veranstaltung sind 50% der erreichbaren Punkte nötig. Aus der erreichten Gesamtpunktzahl wird die Note ermittelt.

Minimum requirements and assessment criteria

Zum Bestehen müssen mindestens 50% der möglichen Gesamtpunktzahl erreicht werden. Der tatsächlich erreichte Prozentsatz bestimmt die Note.

Examination topics

Relevant sind alle in der Lehrveranstaltung und den Übungen vorkommenden und behandelten Inhalte.

Reading list

wird in der Lehrveranstaltung bekannt gegeben

Association in the course directory

Module: BIOINF06

Last modified: Mo 07.09.2020 15:20