053522 VU Bioinformatics for phylogeny and evolutionary tree reconstruction (2019W)
Continuous assessment of course work
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Registration/Deregistration
Note: The time of your registration within the registration period has no effect on the allocation of places (no first come, first served).
- Registration is open from Sa 07.09.2019 09:00 to Mo 23.09.2019 09:00
- Deregistration possible until Mo 14.10.2019 23:59
Details
max. 25 participants
Language: English
Lecturers
Classes (iCal) - next class is marked with N
VB: DO 03.10.2019 10.00-12.00; DO wtl von 03.10.2019 bis 30.01.2020 10.00-12.00 Ort: Seminarraum Strukturchemie, Ebene 1, Campus Vienna Biocenter 5 (VBC5), 1030 Wien
- Thursday 03.10. 10:00 - 12:00 extern
- Thursday 10.10. 10:00 - 12:00 extern
- Thursday 17.10. 10:00 - 12:00 extern
- Thursday 24.10. 10:00 - 12:00 extern
- Thursday 31.10. 10:00 - 12:00 extern
- Thursday 07.11. 10:00 - 12:00 extern
- Thursday 14.11. 10:00 - 12:00 extern
- Thursday 21.11. 10:00 - 12:00 extern
- Thursday 28.11. 10:00 - 12:00 extern
- Thursday 05.12. 10:00 - 12:00 extern
- Thursday 12.12. 10:00 - 12:00 extern
- Thursday 09.01. 10:00 - 12:00 extern
- Thursday 16.01. 10:00 - 12:00 extern
- Thursday 23.01. 10:00 - 12:00 extern
- Thursday 30.01. 10:00 - 12:00 extern
Information
Aims, contents and method of the course
Assessment and permitted materials
Die Beurteilung dieser prüfungsimmanenten Veranstaltung setzt sich aus den folgenden Leistungsnachweisen zusammen:
Zu den Vorlesungen sind gelöste Übungsaufgaben abzugeben. Für die Übungsaufgaben werden Punkte vergeben. Zum Bestehen der Veranstaltung sind 50% der erreichbaren Punkte nötig. Aus der erreichten Gesamtpunktzahl wird die Note ermittelt.
Zu den Vorlesungen sind gelöste Übungsaufgaben abzugeben. Für die Übungsaufgaben werden Punkte vergeben. Zum Bestehen der Veranstaltung sind 50% der erreichbaren Punkte nötig. Aus der erreichten Gesamtpunktzahl wird die Note ermittelt.
Minimum requirements and assessment criteria
Zum Bestehen müssen mindestens 50% der möglichen Gesamtpunktzahl erreicht werden. Der tatsächlich erreichte Prozentsatz bestimmt die Note.
Examination topics
Relevant sind alle in der Lehrveranstaltung und den Übungen vorkommenden und behandelten Inhalte.
Reading list
wird in der Lehrveranstaltung bekannt gegeben
Association in the course directory
Module: BIOINF06
Last modified: Mo 07.09.2020 15:20
It covers topics like: historical background; theoretical basics and definitions; different approaches like maximum parsimony, distance methods, maximum likelihood and Bayesian and associated algorithms; tree search and tree rearrangements; models of sequence evolution and model selection; summarizing trees and branch support; tree topology testing; tracing phylogenetic signal and noise; phylogenomics, supertrees and partition models.
Finally, the includes two hands-on units applying phylogenetic software.