Universität Wien FIND

Due to the COVID-19 pandemic, changes to courses and exams may be necessary at short notice (e.g. cancellation of on-site teaching and conversion to online exams). Register for courses/exams via u:space, find out about the current status on u:find and on the moodle learning platform.

Further information about on-site teaching can be found at https://studieren.univie.ac.at/en/info.

300118 PP Bioinformatics in Mass Spectrometry (2011S)

10.00 ECTS (6.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Continuous assessment of course work

Vorbesprechung am 15.3.2011 um 11.00 Uhr im Seminarraum 1320 (Dep.für molekulare Systembiologie)

Registration/Deregistration

Details

max. 22 participants
Language: German

Lecturers

Classes

Currently no class schedule is known.

Information

Aims, contents and method of the course

Beherrschung der theoretischen und praktischen Grundlagen der Massenspektrometrie. Einführung in die Proteomanalyse,Metabolomanalyse und Systembiologie. Bioinformatik der Proteine:Algorithmen zur Mustersuche,lokale und globale Alignments, Scoring Matrizen,wichtige Algorithmen(Needleman-Wunsch,Smith-Waterman,Fasta,Blast). Einführung in wichtige biologische Datenbanken (Aufbau,Funktion,Formate).
Bioinformatische Proteomanalyse: Datenerfassung,Analyse und Interpretation von Massenspektren .Identifikation von Peptiden in Datenbanken. Bioinformatische Metabolomanalyse: Rekonstruktion molekularer Netzwerke. Analyse molekularer Netzwerke.

Assessment and permitted materials

Minimum requirements and assessment criteria

Erwerben von Kenntnissen über: Spezielle Methoden der Biostatistik:Regressionsanalyse,
PCA,ICA. Erlangen der Qualifikation zur Bearbeitung und Visualisierung bioinformatischer Probleme/ Fragestellungen in der Skriptsprache Python,Struktur biologischer Datenformate, spezielle Algorithmen in der Proteom- und Metabolomforschung. Entwicklung einer automatisierten Annotations pipline.

Examination topics

Reading list


Association in the course directory

B-BOE 12, B-BOE 13, BOE 10, BOE 11, BOE 12

Last modified: Mo 07.09.2020 15:43