300118 PP Bioinformatics in Mass Spectrometry (2015S)

10.00 ECTS (6.00 SWS), SPL 30 - Biologie

Continuous assessment of course work

Moodle

Registration/Deregistration

Note: The time of your registration within the registration period has no effect on the allocation of places (no first come, first served).

Registration is open from Th 05.02.2015 08:00 to Th 19.02.2015 18:00
Deregistration possible until Fr 27.03.2015 18:00

Details

max. 12 participants

Language: German

Lecturers

Classes

Termine: 14.07.15-17.07.15 und 21.07.15-24.07.15 jeweils von 10:00-18:00 Uhr im Seminarraum 1320 (Dep.für molekulare Systembiologie)

Information

Aims, contents and method of the course

Beherrschung der theoretischen und praktischen Grundlagen der Massenspektrometrie.
Einführung in die Proteomanalyse, Metabolomanalyse und Systembiologie.
Einführung in wichtige biologische Datenbanken (Aufbau,Funktion,Formate).
Bioinformatische Proteomanalyse: Datenerfassung,Analyse und Interpretation von Massenspektren. Identifikation von Peptiden in Datenbanken.

Assessment and permitted materials

Prüfungsimmanente Mitarbeit während des Kurses, schriftliches Protokoll, Seminarvortrag.

Minimum requirements and assessment criteria

Erwerben von Kenntnissen über: Spezielle Methoden der Biostatistik, grundlegende mathematischer und heuristische Algorithmen in der proteomischen Bioinformatik
Erlangen der Qualifikation zur Bearbeitung und Visualisierung bioinformatischer Probleme/ Fragestellungen in der Skriptsprache Python,
Struktur biologischer Datenformate, spezielle Algorithmen in der massenspektrometrischen Analyse Proteom- und Metabolomforschung.
Entwicklung eines eigenen Algorithmus für die Proteinidentifikation.

Examination topics

Reading list

Association in the course directory

B-BOE 12, B-BOE 13

Last modified: Mo 07.09.2020 15:43