Universität Wien FIND

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300206 UE Genetic tools in ecology and conservation (2021W)

5.00 ECTS (3.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Continuous assessment of course work
ON-SITE

Registration/Deregistration

Note: The time of your registration within the registration period has no effect on the allocation of places (no first come, first served).

Details

max. 12 participants
Language: German

Lecturers

Classes (iCal) - next class is marked with N

Beachten Sie das die Vorbesprechung digital auf BigBlueButton stattfindet. Vorbesprechung: 07. Okt. 2021, 11:15 Uhr bis 12:00 Uhr. Informationen zum Zugang zur online Vorbesprechung wurden am 01. Oktober per email ausgesandt. Der Kurs selbst soll wenn möglich vor-Ort stattfinden. Eine Umstellung auf ein online Format kann jedoch notwendig werden.

Thursday 07.10. 11:15 - 12:00 Digital
Tuesday 15.02. 10:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Wednesday 16.02. 10:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Thursday 17.02. 10:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Friday 18.02. 10:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG

Information

Aims, contents and method of the course

In diesem anwendungsorientierten Kurs sollen die Studierenden lernen wie genetische Daten als Werkzeug in Ökologie, Biodiversitätsforschung und Naturschutz herangezogen werden können. Die Auswertung wird zum Großteil in R stattfinden. Es sind jedoch keine Vorkenntnisse in R notwendig um an diesem Kurs teilzunehmen.

Neben den Grundlagen im Umgang mit DNA Sequenzdaten werden folgende gebräuchliche Methoden sollen primär behandelt werden:

1. Methoden zur Bestimmung von Arten mittels DNA Sequenzdaten (zb DNA Barcoding und einfache phylogenetische Analysen).

2. Methoden zur Abgrenzung von noch nicht taxonomisch beschriebenen Arten mittels DNA Sequenzdaten. Zb in schlecht untersuchten tropischen Habitaten mit hoher Artenzahl.

3. Einfache phylogeographische Analysen zur Einschätzung der genetischen Differenzierung über das gesamtes Verbreitungsareal einer Art (zb Haplotypennetzwerke, Berechnung von Kennzahlen der genetischen Diversität).

Ein zentrales Element des Kurses wird sein wie Ergebnisse aus diesen drei methodischen Ansätzen praxisorientiert interpretiert werden und welche Konsequenzen und Nutzen solche Erkenntnisse in Bezug auf ökologische Untersuchungen sowie im Naturschutz haben.

Dieser Kurs wird sich mit Beispielen aus dem Tierreich (vor allem Schmetterlinge, Vögel und Säugetiere) befassen, die angewandten Methoden lassen sich jedoch weitgehend auch auf Pflanzen anwenden.

Assessment and permitted materials

Die Studierenden werden in Zweiergruppen in sich abgeschlossene Themen bearbeiten.

Ich bitte Sie ihren eigenen Rechner zum Kurs mitzubringen. Wenn Sie nicht in der Lage sind, einen eigenen Rechner mitzubringen, geben Sie das bitte bei der Vorbesprechung oder per Email bekannt. Rechner mit Windows, MacOS und Linux sind gleichermaßen geeignet.

Die Leistung im Kurs wird in zwei Teilleistungen beurteilt, einerseits die Mitarbeit im Kurs und andererseits ein schriftlicher Abschlußbericht. Im Zuge der Mitarbeit im Kurs wird von Ihnen erwartet das sie aktiv am Kurs teilnehmen und Eigeninitiative bei der Bearbeitung ihrer Aufgabenstellung, vor allem bei der Lösung auftretender Probleme und sonstiger Hindernisse zeigen.

Die Studierenden sollen durch Verfassen eines schriftlichen Abschlußberichts zeigen, daß sie in der Lage sind, die relevanten Aspekte der im Kurs bearbeiteten Themen zu erkennen und diese in einer schriftlichen Arbeit darzustellen. Die gewonnenen Ergebnisse sollen dabei interpretiert und mit der aktuellen Literatur in Bezug gesetzt werden. Dieser Bericht ist in deutscher oder englischer Sprache zu verfassen; die Länge des Berichts soll ca. 4000 bis 6000 Wörter betragen. Detailtiere Instruktionen werden am ersten Kurstag bekanntgegeben. Der Bericht soll in zweier-Gruppen verfaßt werden.

Minimum requirements and assessment criteria

1. Aktive Teilnahme am Kurs

2. Abgabe eines schriftlichen Berichts in einer Rohfassung bis spätestens 28. März 2022. Die Endfassung ist bis spätestens 25. April 2022 abzugeben. Bei fristgerechter Abgabe einer ersten Version erhalten Sie Verbesserungsvorschläge und haben bis zur finalen Frist Zeit ihren Bericht zu verbessern.

3. Im Kurs besteht Anwesenheitspflicht an allen Kurstagen inklusive der Vorbesprechung am [siehe oben]. Eine entschuldigte Abwesenheit von bis zu einem kompletten Kurstag ist zulässig. Sollten Sie an die Vorbesprechung nicht teilnehmen können ist es unbedingt notwendig dies zb per Email bekanntzugeben.

Die Gesamtnote setzt sich wie folgt zusammen:
Mitarbeit im Kurs 40%
Schriftlicher Bericht 60%

Beide Teilleistungen müssen positiv abgeschlossen werden um eine positive Gesamtnote zu erhalten.

Examination topics

Der schriftliche Bericht ist auf Grundlage der im Kurs erarbeiteten Ergebnisse in Kombination mit ergänzender Literatur anzufertigen.

Reading list

Literaturhinweise werden während der Lehrveranstaltung gegeben darüber hinaus wird Literatur auf der moodle Plattform zur Verfügung gestellt.

Association in the course directory

MEC-9, MZO W-2, MZO W-4, MZO4, MBO 7, MNB3

Last modified: Fr 01.10.2021 14:50