Universität Wien

300354 UE Molecular phylogenetics (2014W)

Phylogenetic (and other ) analyses using BEAST

5.00 ECTS (3.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Continuous assessment of course work

The initial meeting will be on 15. Oct., 12:00-13:00, ÜR 1.
Planned dates for the course (determined by the availability of rooms):
20.10., 21.10., 27.10., 28.10., 17.11., 18.11., 15.12., 16.12.
Moodle

Registration/Deregistration

Note: The time of your registration within the registration period has no effect on the allocation of places (no first come, first served).

Details

max. 10 participants
Language: English

Lecturers

Classes (iCal) - next class is marked with N

  • Wednesday 15.10. 12:00 - 13:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
  • Monday 20.10. 10:00 - 16:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
  • Tuesday 21.10. 10:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
  • Monday 27.10. 10:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
  • Tuesday 28.10. 10:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
  • Monday 17.11. 10:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
  • Tuesday 18.11. 10:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
  • Monday 15.12. 10:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
  • Tuesday 16.12. 10:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
  • Thursday 29.01. 10:00 - 16:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
  • Friday 30.01. 10:00 - 16:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG

Information

Aims, contents and method of the course

Evolutionary analyses using free software packages (mainly, but not only BEAST [Bayesian Evolutionary Analysis by Sampling Trees]) with emphasis on phylogeny reconstruction, molecular dating and phylogeographic analysis.

Assessment and permitted materials

active participation (100%)

Minimum requirements and assessment criteria

Students are acquainted with relevant software packages (e.g., BEAST) and their underlying theoretical background and can apply those to address evolutionary questions (such as phylogeny reconstruction, molecular dating, phylogeographic analyses).

Examination topics

Presentation (20%) and practical exercise (80%)

Reading list

http://beast2.org/book.html
Lemey P et al. (eds), 2009: The Phylogenetic Handbook, 2nd ed. Cambridge Univ. Press
Yang Z, 2006: Computational Molecular Evolution. Oxford Univ. Press
Felsenstein J, 2004: Inferring Phylogenies. Sinauer

Association in the course directory

MBO5, MPF W-1, MEV W-6

Last modified: Mo 07.09.2020 15:43