Warning! The directory is not yet complete and will be amended until the beginning of the term.

301590 VU Fundamental Bioinformatics (2025W)

5.00 ECTS (3.00 SWS), SPL 30 - Biologie

Continuous assessment of course work

Tu 07.10. 08:00-13:00 BIG-Hörsaal Hauptgebäude, Tiefparterre Stiege 1 Hof 1

Details

max. 130 participants

Language: English

Lecturers

Classes (iCal) - next class is marked with N

see german version

N Tuesday 07.10. 08:00 - 13:00 BIG-Hörsaal Hauptgebäude, Tiefparterre Stiege 1 Hof 1
Tuesday 14.10. 08:00 - 13:00 BIG-Hörsaal Hauptgebäude, Tiefparterre Stiege 1 Hof 1
Tuesday 21.10. 08:00 - 13:00 BIG-Hörsaal Hauptgebäude, Tiefparterre Stiege 1 Hof 1
Tuesday 28.10. 08:00 - 13:00 BIG-Hörsaal Hauptgebäude, Tiefparterre Stiege 1 Hof 1
Tuesday 04.11. 08:00 - 13:00 BIG-Hörsaal Hauptgebäude, Tiefparterre Stiege 1 Hof 1
Tuesday 11.11. 08:00 - 13:00 BIG-Hörsaal Hauptgebäude, Tiefparterre Stiege 1 Hof 1
Tuesday 18.11. 08:00 - 13:00 BIG-Hörsaal Hauptgebäude, Tiefparterre Stiege 1 Hof 1
Tuesday 25.11. 08:00 - 13:00 BIG-Hörsaal Hauptgebäude, Tiefparterre Stiege 1 Hof 1
Tuesday 02.12. 08:00 - 13:00 BIG-Hörsaal Hauptgebäude, Tiefparterre Stiege 1 Hof 1
Tuesday 09.12. 08:00 - 13:00 BIG-Hörsaal Hauptgebäude, Tiefparterre Stiege 1 Hof 1
Tuesday 16.12. 08:00 - 13:00 BIG-Hörsaal Hauptgebäude, Tiefparterre Stiege 1 Hof 1
Tuesday 13.01. 08:00 - 13:00 BIG-Hörsaal Hauptgebäude, Tiefparterre Stiege 1 Hof 1
Tuesday 20.01. 08:00 - 13:00 BIG-Hörsaal Hauptgebäude, Tiefparterre Stiege 1 Hof 1
Tuesday 27.01. 08:00 - 13:00 BIG-Hörsaal Hauptgebäude, Tiefparterre Stiege 1 Hof 1

Information

Aims, contents and method of the course

Introduction to basic bioinformatical algorithms, in particular sequence
analysis methods.
sequence similarity; dynamic programming; alignment algorithms
(Needleman-Wunsch, Smith-Waterman, Gotoh, BLAST and FASTA);
multiple alignments; clustering and phylogeny reconstruction; RNA secondary
structures.
Course material: Lecture notes
Grading: Home assignments and tests

Assessment and permitted materials

Home assignments and 2 written tests
Permitted materials for tests: Calculator

Minimum requirements and assessment criteria

Understanding basic algorithms for sequence analysis as well as selected
algorithms for phylogeny reconstruction and structure prediction.
Assessment: Weighted average of grades on home assignments and tests

Examination topics

Content of lectures and slides

Reading list

See moodle

Association in the course directory

BMB 7, BMG 7

Last modified: Fr 27.06.2025 00:02