Universität Wien

300354 UE Molecular phylogenetics and phylogenomics (2017W)

5.00 ECTS (3.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung

The course consists of 8 units half a day (4 hours) each (when necessary or topically useful, there might be two units per day). The course will be held semi-blocked (i.e., not the whole semester, but spread over several weeks). Precise course dates will be established during the initial meeting.

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Details

max. 10 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

Initial meeting ("Vorbesprechung"): 9. Oct., 12:00, ÜR 1 (first floor), Rennweg 14, 1030 Wien

Montag 09.10. 12:00 - 13:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Montag 20.11. 09:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Mittwoch 22.11. 09:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Montag 22.01. 09:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Mittwoch 24.01. 09:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Freitag 26.01. 09:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Montag 29.01. 09:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Mittwoch 31.01. 09:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Evolutionary analyses using free software packages (e.g., BEAST, RAxML) with emphasis on phylogeny reconstruction, molecular dating and analysis of phylogenomic data.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

One home exercise per unit, each to be documented in the form of a short and concise protocol. Each protocol can get maximally 5 points, totaling 40 points for the entire course.

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Minimum requirement for positive credit: 20.5 points
(credit key:
0-20 points: 5
20.5-25 points: 4
25.5-30 points: 3
30.5-35 points: 2
35.5-40 points: 1)

Prüfungsstoff

Presentation (20%) and practical exercise (80%)

Literatur

http://beast2.org/book.html
Lemey P et al. (eds), 2009: The Phylogenetic Handbook, 2nd ed. Cambridge Univ. Press
Yang Z, 2006: Computational Molecular Evolution. Oxford Univ. Press
Felsenstein J, 2004: Inferring Phylogenies. Sinauer

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

MBO 5, MEV W-6, MZO 2, M-WZB

Letzte Änderung: Mo 07.09.2020 15:43