300354 UE Molecular phylogenetics and phylogenomics (2017W)
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
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The course consists of 8 units half a day (4 hours) each (when necessary or topically useful, there might be two units per day). The course will be held semi-blocked (i.e., not the whole semester, but spread over several weeks). Precise course dates will be established during the initial meeting.
An/Abmeldung
Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").
- Anmeldung von Do 07.09.2017 08:00 bis Do 21.09.2017 18:00
- Abmeldung bis Di 31.10.2017 18:00
Details
max. 10 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch
Lehrende
Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert
Initial meeting ("Vorbesprechung"): 9. Oct., 12:00, ÜR 1 (first floor), Rennweg 14, 1030 Wien
Montag
09.10.
12:00 - 13:00
Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Montag
20.11.
09:00 - 17:00
Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Mittwoch
22.11.
09:00 - 17:00
Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Montag
22.01.
09:00 - 17:00
Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Mittwoch
24.01.
09:00 - 17:00
Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Freitag
26.01.
09:00 - 17:00
Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Montag
29.01.
09:00 - 17:00
Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Mittwoch
31.01.
09:00 - 17:00
Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Information
Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung
Evolutionary analyses using free software packages (e.g., BEAST, RAxML) with emphasis on phylogeny reconstruction, molecular dating and analysis of phylogenomic data.
Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel
One home exercise per unit, each to be documented in the form of a short and concise protocol. Each protocol can get maximally 5 points, totaling 40 points for the entire course.
Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab
Minimum requirement for positive credit: 20.5 points
(credit key:
0-20 points: 5
20.5-25 points: 4
25.5-30 points: 3
30.5-35 points: 2
35.5-40 points: 1)
(credit key:
0-20 points: 5
20.5-25 points: 4
25.5-30 points: 3
30.5-35 points: 2
35.5-40 points: 1)
Prüfungsstoff
Presentation (20%) and practical exercise (80%)
Literatur
http://beast2.org/book.html
Lemey P et al. (eds), 2009: The Phylogenetic Handbook, 2nd ed. Cambridge Univ. Press
Yang Z, 2006: Computational Molecular Evolution. Oxford Univ. Press
Felsenstein J, 2004: Inferring Phylogenies. Sinauer
Lemey P et al. (eds), 2009: The Phylogenetic Handbook, 2nd ed. Cambridge Univ. Press
Yang Z, 2006: Computational Molecular Evolution. Oxford Univ. Press
Felsenstein J, 2004: Inferring Phylogenies. Sinauer
Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis
MBO 5, MEV W-6, MZO 2, M-WZB
Letzte Änderung: Mo 07.09.2020 15:43