300354 UE Molecular phylogenetics and phylogenomics (2018W)

Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung

Moodle

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Anmeldung von Do 06.09.2018 08:00 bis Do 20.09.2018 18:00
Abmeldung bis Mi 31.10.2018 18:00

Details

max. 10 Teilnehmer*innen

Sprache: Englisch

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

Initial meeting will be held in October; date will be announced separately.

    
    Freitag
    12.10.
    09:00 - 10:00
    Seminarraum (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg EG
    
    Donnerstag
    25.10.
    09:00 - 17:00
    Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
    
    Donnerstag
    22.11.
    09:00 - 17:00
    Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
    
    Donnerstag
    29.11.
    09:00 - 17:00
    Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
    
    Donnerstag
    13.12.
    09:00 - 17:00
    Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
    
    Donnerstag
    10.01.
    09:00 - 17:00
    Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
    
    Donnerstag
    24.01.
    09:00 - 17:00
    Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Evolutionary analyses using free software packages (e.g., PAUP, RAxML, BEAST) with emphasis on phylogeny reconstruction, molecular dating and analysis of phylogenomic data, including coalescent methods.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

One home exercise per unit, each to be documented in the form of a short and concise protocol. Each protocol can get maximally 5 points, totaling 40 points for the entire course.

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Minimum requirement for positive credit: 20.5 points
(credit key:
0-20 points: 5
20.5-25 points: 4
25.5-30 points: 3
30.5-35 points: 2
35.5-40 points: 1)

Prüfungsstoff

Presentation (20%) and practical exercise (80%)

Literatur

http://beast2.org/book.html
https://paup.phylosolutions.com
Lemey P et al. (eds), 2009: The Phylogenetic Handbook, 2nd ed. Cambridge Univ. Press
Yang Z, 2006: Computational Molecular Evolution. Oxford Univ. Press
Felsenstein J, 2004: Inferring Phylogenies. Sinauer

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

MBO 5, MZO 2, M-WZB

Letzte Änderung: Mo 07.09.2020 15:43