300354 UE Molecular phylogenetics and phylogenomics (2018W)
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
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An/Abmeldung
Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").
- Anmeldung von Do 06.09.2018 08:00 bis Do 20.09.2018 18:00
- Abmeldung bis Mi 31.10.2018 18:00
Details
max. 10 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch
Lehrende
Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert
Initial meeting will be held in October; date will be announced separately.
- Freitag 12.10. 09:00 - 10:00 Seminarraum (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg EG
- Donnerstag 25.10. 09:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
- Donnerstag 22.11. 09:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
- Donnerstag 29.11. 09:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
- Donnerstag 13.12. 09:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
- Donnerstag 10.01. 09:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
- Donnerstag 24.01. 09:00 - 17:00 Übungsraum 1 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
Information
Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung
Evolutionary analyses using free software packages (e.g., PAUP, RAxML, BEAST) with emphasis on phylogeny reconstruction, molecular dating and analysis of phylogenomic data, including coalescent methods.
Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel
One home exercise per unit, each to be documented in the form of a short and concise protocol. Each protocol can get maximally 5 points, totaling 40 points for the entire course.
Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab
Minimum requirement for positive credit: 20.5 points
(credit key:
0-20 points: 5
20.5-25 points: 4
25.5-30 points: 3
30.5-35 points: 2
35.5-40 points: 1)
(credit key:
0-20 points: 5
20.5-25 points: 4
25.5-30 points: 3
30.5-35 points: 2
35.5-40 points: 1)
Prüfungsstoff
Presentation (20%) and practical exercise (80%)
Literatur
http://beast2.org/book.html
https://paup.phylosolutions.com
Lemey P et al. (eds), 2009: The Phylogenetic Handbook, 2nd ed. Cambridge Univ. Press
Yang Z, 2006: Computational Molecular Evolution. Oxford Univ. Press
Felsenstein J, 2004: Inferring Phylogenies. Sinauer
https://paup.phylosolutions.com
Lemey P et al. (eds), 2009: The Phylogenetic Handbook, 2nd ed. Cambridge Univ. Press
Yang Z, 2006: Computational Molecular Evolution. Oxford Univ. Press
Felsenstein J, 2004: Inferring Phylogenies. Sinauer
Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis
MBO 5, MZO 2, M-WZB
Letzte Änderung: Mo 07.09.2020 15:43